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摘要
客觀的從患者身上提取的臨床樣本注釋是轉化醫學研究的基礎，並為藥物試驗提供了機製的見解。組織目錄和協調中心(TDCC)先前的研究表明，研究人員，特別是那些在工業領域的研究人員，在獲取患者樣本時麵臨許多障礙。2019冠狀病毒病(COVID-19)大流行在英國產生了立即和極端的衝擊波，影響了進行所有關鍵轉化研究的能力。作為一個國家協調中心，TDCC的任務是提高生物銀行部門的效率。因此，我們負責確定和協調能夠在2020年3月至9月期間為研究人員收集與covid -19相關樣本的英國組織樣本收集組織(生物庫)。
發現在英國COVID-19大流行的第一波期間，英國近三分之一的生物銀行關閉了。剩下的人中，43%的人能力有限，26%的人保持正常活動。在國家優先考慮的COVID-19介入研究中，在回答問題的5個研究中，隻有3個收集了人類樣本。在TDCC收到的41項COVID-19樣本請求中，由於英國缺乏協調戰略，隻有4項請求得以滿足。與此同時，在後台有大量的報告表明，英國的樣本收集在很大程度上仍未得到充分利用。
結論應對大流行需要高水平協調的研究應對措施，以降低死亡率。我們的研究突出了全英國人類樣本收集和臨床試驗之間缺乏效率和協調。英國的樣本獲取對研究人員、臨床醫生或患者都不起作用。需要徹底改變樣本收集和分發的策略，以最大限度地利用這一寶貴的人類捐贈樣本資源。
- 衛生信息學
- 新型冠狀病毒肺炎
- 倫理學(見醫學倫理學)
- 衛生政策
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背景
為醫學研究獲取注釋良好的人體樣本是一個關鍵而複雜的過程。研究人員在獲取和使用人體樣本時麵臨著許多障礙，倫理審批過程就是其中之一。1研究還表明，行業終端用戶在尋找用於研究的樣本方麵麵臨重大挑戰，導致使用劣質替代品，如動物模型。2目前的樣本收集係統仍然由研究項目資金支持，這需要並鼓勵研究人員在設計、倫理和法律治理應用程序以及人類樣本的獲取方麵投入時間和資源。這是在與其他研究人員的競爭中完成的，導致了一種不可避免的“所有權”感，而不是在更廣泛的科學努力中進行合作。英國臨床研究合作組織(UKCRC)組織目錄和協調中心(TDCC)成立於2014年，以宣傳現有的樣本收集並改善樣本獲取。3.截至2020年4月，UKCRC TDCC的樣本發現平台“組織目錄”已注冊220個人類生物銀行組織，包括生物銀行、隊列研究和臨床試驗。這些組織大多由公立大學或國家衛生服務醫院主辦。研究人員可以搜索這個免費訪問的在線目錄，找到合適的研究樣本。4TDCC尋求通過提高現有基礎設施的可視性來提高該部門的效率。COVID-19大流行對生物醫學研究的生物銀行提出了挑戰，但也為收集失敗和成就的數據提供了機會，以便在未來更好地整合該部門。
最近對人體組織研究人員的一項調查表明，研究人員通過已建立的本地網絡收集樣本，而不是從其他機構獲取和使用樣本，這仍然是非常普遍的做法。1考慮到獲得研究資金所需的時間和精力，在任何特定研究項目中收集的樣本和相關數據通常被視為研究小組(學術或商業)的資產，而不是為了更大的社會利益而共享的資源。因此，盡管資助者和監管機構建立了許多機製，以促進研究和成果傳播中的透明度和現有基礎設施的重用，但有許多可以理解的原因和動機導致研究人員不願廣泛分享樣本。
在英國COVID-19大流行第一波期間(3月至9月)的25周內，TDCC收到了41份幫助尋找與COVID-19相關樣本的請求。TDCC僅能協助四名研究人員獲取他們所需的樣本。
2019冠狀病毒病大流行期間的人類樣本收集和分享
在UKCRC組織目錄注冊的所有220個組織收集組織都收到了多達三次的電子郵件，詢問他們在COVID-19大流行期間的業務狀態。圖1總結響應流程。150個組織收集組織做出了回應(68%)。其中111家(74%)關閉(68家)或運營能力下降(43家)。150個組織中隻有26個(17%)的業務與大流行前一樣。其餘13架飛機的運行狀況未知。
2019冠狀病毒病大流行期間(2020年3月至9月)英國組織庫的狀況。
關閉或減少產能的原因如下:
場地關閉(17.15.3%)。
重新分配人員或資源以支持NHS COVID-19工作(17;15.3%)。
在家或異地工作的員工(15人;13.5%)。
暫停非必要的研究(10;9.9%)。
管理或組織決策(6;5.4%)。
已完成或尚未開始的研究(2;1.8%)。
健康和安全問題(1;0.1%)。
沒有提供信息(43;38.7%)。
在照常運營(26家)或降低產能(43家)的69家醫院中，隻有12家回應說，他們能夠接觸到COVID-19患者，采集COVID-19樣本。此外，其中9個(75%)已經向內部項目提供樣本，因此，無法更廣泛地共享向額外的外部研究項目提供樣本。
令人震驚的是，在這場國際衛生危機中，74%的英國人體組織收集組織不是關閉就是沒有全麵運作。對我們的呼籲做出回應的醫院中，有近一半是完全關閉的，而不是被視為擁有有利於研究或患者護理的技能和經驗。還考慮到對COVID-19研究援助的高需求，收集COVID-19樣本的項目和組織錯過了通過宣傳其收集或提供樣本的能力來支持其他研究的機會。
討論
樣本來源問題影響了英國中小型企業和公共衛生機構以及專家學術研究小組為重要研究項目獲取樣本的能力。5個6例如，向TDCC提交的樣本請求中有近三分之二來自私人研究機構。然而，由於剩下的三分之一來自大學研究小組，樣本獲取是公共和商業研究人員都麵臨的挑戰。當前的研究文化(資助者、監管機構、獎勵、先例)並沒有鼓勵或促進共享，而是鼓勵了競爭。
需要對該係統進行實質性更改，以提供改進人體組織訪問的解決方案。1 72019冠狀病毒病大流行暴露了缺乏積極和預先協調的國家戰略和國家基礎設施的後果。我們需要一種新的人類樣本研究方法，使患者放心，科學和生物銀行社區正在充分利用他們捐贈的樣本8在某種程度上，這與捐贈過程中給予同意的精神是一致的。
與數據的協調和共享相反
英國每個國家都有支持服務，為NHS收集數據，這成為醫療保健研究人員獨一無二的寶貴資源，其規模在全球是無與倫比的。NHS-X最近已經建立，以進一步利用領先的數據科學計劃中的數據。與此形成鮮明對比的是，在NHS中收集的組織樣本沒有NHS- d /X等價物。
英國健康數據研究中心(HDR UK)成立於2018年，目前已啟動了許多備受矚目的數據協調工作，重點是開放標準和互操作性，作為這些活動的基石。在某些方麵，HDR UK可以被認為與TDCC對患者樣本的數據相當。然而，最根本的區別是，HDR UK已經能夠資助八個網絡(BREATHE, data - can, Gut Reaction, INSIGHT, NHS DigiTrials, PIONEER, discovery - now和BHF數據科學中心)的主題數據收集工作，以及國家研究主題下的一般能力，這些網絡來自其原始的專門和實質性站點(劍橋，倫敦，米德蘭茲，北方，牛津，蘇格蘭，西南，威爾士和北愛爾蘭)。因此，HDR UK有一個現成的有資金支持的網絡，在這個網絡中，它可以指導和通知變化，而不是簡單地倡導數據共享和協作工作的好處，這是人類樣本協調工作的曆史和脫節的案例。全係統的變化是一個挑戰，HDR UK和它所協調的網絡為跨數據集操作的新方式提供了一盞明燈。
收集人體樣本在很多方麵都是達到目的的一種手段。樣本是研究和解決許多重要臨床問題的原料。高質量的數據是高質量樣本管道的副產品。TDCC支持以數據為中心的生物銀行，它強調的是帶有樣本的數據集，而不是“帶有注釋數據的樣本”集合。然而，這一直是一個倡導的角色，沒有監管或資金支持，這使得使用這種策略很難實現變革，並依賴於意願的整理。
為應對2019冠狀病毒病，這些數據資產得到了重視，並進一步獲得了立法的支持。9在國家核心研究項目下，820萬英鎊投資於一個新的國家數據連接基礎設施，初始期為6個月，該項目建立在已建立的資金流基礎上，以支持英國HDR和國家可信研究環境。這將為子孫後代留下遺產，為應對COVID-19而啟動的數據連接和數據基礎設施應該很容易成為新常態。
相比之下，英國沒有任何倡議來資助或推動大流行期間人類樣本收集和共享的協調工作，也沒有任何監管變化來支持在應對COVID-19時更好地使用樣本。顯然，有一些以直接或間接目的收集樣本為研究重點的國家努力，如英國COVID-19基因組學聯盟(COG-UK)、國際嚴重急性呼吸道和新發感染聯盟(ISARIC)和社區傳播實時評估(REACT)研究。然而，這些研究之間又一次沒有協調。這種研究專注於樣本收集，而不是保持可操作性，這可能是許多組織收集機構在COVID-19期間關閉的原因。相反，它們本可以被視為具有技術專長的基礎設施，無論它們的研究專長如何，都可以被重新利用，作為國家應對措施的一部分。例如，如果生物銀行在很大程度上取決於它們所支持的研究，那麼在許多其他研究被暫停的同時，它們的運作也將被暫停，這將是一個合乎邏輯的結果。這造成的結果是，仍在運作的更麵向服務的生物庫無法滿足它們當時經曆的需求量。
一個全國性的人體組織方法可以帶來與NHS數據收集所取得的同樣的效率和高級別治理。組織同意的法律基礎及其途徑(如注冊、同意、選擇退出等)都可以在國家層麵上加以界定。NHS每年存儲數百萬個人體組織樣本，這些樣本可以與國家數據集相匹配，用於學術和商業研究的利益。組織樣本對於支持研究和預防當今疾病以及應對未來的大流行病至關重要。
未來
COVID-19研究得到了公眾的大力支持。我們在COVID-19治療試驗隨機評估(恢複試驗)中招募了創紀錄的參與者，10公眾注冊成為測試新疫苗和緩解症狀藥物的參與者，以及ZOE app等大規模公眾活動，這有助於指導症狀谘詢。公眾的熱情和支持可能是由於集體努力支持研究，以解決影響每個人的問題，以及及時提供關於他們的參與如何發揮作用的信息。公眾同樣支持其他領域的生物銀行活動，而且據報道，同意率總是很高。
可以理解的是，患者可能會認為，在他們一生中以利他的方式捐贈的組織樣本，可以通過適當監管的生物銀行分配，最佳地用於多個臨床試驗或研究研究。然而，正如COVID-19大流行所突顯的那樣，目前他們捐贈的樣本大部分仍被鎖定在個別研究中，樣本無法為國家需求做出貢獻。目前在研究項目中資助樣本收集的方法存在這樣的風險:它們被該研究項目定義。治理、同意、獲取和重點都是由這項研究定義的，而不是作為一種可以更廣泛地獲取和重用的資源，以實現更大的社會健康效益。這種以研究為主導的方法的後果可以在應對COVID-19中清楚地看到。建立生物庫的研究主題與生物庫能夠支持的內容之間有著密不可分的聯係，這意味著在應對COVID-19疫情時，許多生物庫關閉了。在2019冠狀病毒病中采取的國家方法重複了以前的方法，即為作為研究研究的一部分的新樣本收集提供資金，從而建立了隻能進行回顧性收集的研究豎井。要認識到人體組織在研究中的巨大價值，特別是當與國家數據集相關聯時，如果我們真正尋求一種不同的研究文化，我們必須考慮在樣本收集活動中協調的新方法，在這種文化中，樣本不是作為研究的財產保存下來，而是作為公眾捐贈的禮物用於進一步研究。
例如，如果將樣本協調嵌入到COVID-19期間進行的臨床試驗等相關舉措中會怎樣?在不同的協調水平下，RECOVERY試驗可以取一小部分血液，或者同意將多餘的血液與醫院常規檢測的血液一起收集。這樣就可以滿足TDCC收到的樣本訪問請求，並支持英國COVID-19研發活動的快速和顯著增加。這當然不是對RECOVERY的批評，因為他們隻能在當前的約束和期望下運作。然而，平行排列組織或樣本收集本可以在不增加試驗計劃複雜性或延遲的情況下實現。從整體應對COVID-19的大局來看，這是一個錯失的機會。挑戰在於，如果沒有一個新穎而一致的策略，一個協調的重用方法就不會被視為一個機會，而是一個激進的和不可實現的願望。
結論
2019冠狀病毒病大流行表明，生物銀行沒有作為一項整體服務或自身基礎設施得到優先重視，以支持關鍵的一線研究。這一情況可歸因於普遍缺乏促進獲取和有效利用捐贈患者樣本的國家戰略和協調，而在衛生數據收集和分析等重要研究的相關領域則沒有這種情況。在大流行開始時，時間至關重要，但沒有滿足更廣泛的樣本需求，盡管一些設施積極收集樣本用於一般收集和特定研究——其中一些參與研究的記錄很高。這表明錯過了最大化有效利用資源的機會，並引起了對如何使用捐贈樣本的關注。一項由政府、監管機構和大型研究資助機構支持和加強的生物銀行國家戰略，將確保將常規樣本收集視為與常規數據收集具有同等價值的國家資源的協調達到一個新的水平。這將確保每一筆捐贈都能充分用於積極的研究，而不是作為一種資產，以備將來可能使用。
倫理語句
病人同意發表
倫理批準
不適用。
腳注
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資金本研究得到醫學研究委員會資助號MR/R022488/1。
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