條文本

原始研究
在印尼住院兒童社區獲得性肺炎的流行病學:多中心、前瞻性研究
  1. 戴維·Lokida1,
  2. Helmia Farida2,
  3. Rina Triasih3,
  4. 燕Mardian4,
  5. 赫爾曼Kosasih4,
  6. Adhella Menur Naysilla4,
  7. Arif Budiman1,
  8. Chakrawati Hayuningsih1,
  9. 衛生部Syarofil安南2,
  10. 醉酒駕車Wastoro2,
  11. Mujahidah Mujahidah3,
  12. Setya Dipayana2,
  13. 阿瑪莉亞Setyati3,
  14. 阿布Tholib阿曼3,
  15. Nurhayati Lukman4,
  16. 默罕默德Karyana5,
  17. Ahnika克萊恩6,
  18. 亞倫尼爾6,
  19. Chuen-Yen劉7,
  20. 克利福德巷6
  1. 1縣綜合醫院,,萬丹、印度尼西亞
  2. 2大Sakit Umum Pusat Kariadi博士,一直以來,爪哇、印度尼西亞
  3. 3大Sakit Umum Pusat Sardjito博士,Sleman,DIY、印度尼西亞
  4. 4印尼在傳染病研究夥伴關係,雅加達、印度尼西亞
  5. 5國家健康研究所的研究和發展,衛生部,印度尼西亞共和國,雅加達、印度尼西亞
  6. 6國家過敏症和傳染病研究所,貝塞斯達,馬裏蘭美國
  7. 7國家癌症研究所,貝塞斯達,馬裏蘭美國
  1. 對應到燕Mardian博士;ymardian在}{ina-respond.net

文摘

客觀的識別目的:兒童社區獲得性肺炎(CAP)基於綜合診斷方法。

設計的合作增強參與Research-Pneumonia兒科學(PEER-PePPeS)的研究是一項觀察性前瞻性群組研究從2017年7月到2019年9月。

設置政府推薦教學醫院在三個城市在印度尼西亞和衛星網站:一直以來,日惹和坦。

參與者住院兒童2-59個月符合肺炎都有資格的標準。孩子們被排除在外,如果他們已經住院> 24小時;有惡性腫瘤或惡性腫瘤史;長期(> 2個月)的曆史類固醇治療,或條件,可能會妨礙符合研究過程。

主要結果(s)測量(s)致病細菌、病毒或混合了肺炎病原體(s)決定使用微生物、分子和血清學測試從定期收集標本(血液、痰和鼻咽拭子)。我們應用先前發表的算法(PEER-PePPeS規則)來確定致病病原體(s)。

結果188名受試者。基於我們的算法,48例(25.5%)有細菌感染,31例(16.5%)有病毒感染,76名(40.4%)混合細菌和病毒感染,和33(17.6%)無法被分類。是確定的五種最常見的病原體流感嗜血杆菌實B (N = 73, 38.8%)、呼吸道合胞體病毒(RSV) (N = 51歲的27.1%),肺炎克雷伯菌(N = 43歲的22.9%),鏈球菌引起的肺炎(N = 29, 15.4%)和流感病毒(N = 25, 13.3%)。RSV和流感病毒診斷高度與印尼雨季(November-March)有關。PCR分析誘導痰標本(是)捕獲大部分病原體識別在這個研究。

結論我們的研究發現,流感嗜血杆菌實B和RSV是最常確認病原體導致住院帽在印尼2-59個月大的嬰兒。我們的研究也強調了PCR診斷的重要性,進而合理使用抗菌素。

小道注冊號NCT03366454

  • 流行病學
  • 傳染病
  • 兒科

數據可用性聲明

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本研究的優點和局限性

  • 未來多點研究了27個月。

  • 使用一個全麵的診斷方法(文化、分子檢測和配對血清學分析)來識別病原體從定期收集標本(血液、痰和鼻咽拭子)。

  • 相對比較小的樣本大小、地理限製爪哇島和觀察設計限製generalisability和因果推論。

  • 我們沒有收集肺吸入物或胸膜液標本,測定首選的肺炎病原學、和不包括健康控製孩子,限製能力估計調整人口歸因分數為每個病原體。

  • 原因不明的肺炎是由幾個病例,這可能是由於抗生素管理文化之前,痰液質量差,細菌和病毒板有限,缺乏真菌測試或另一個因素。

介紹

肺炎是兒童死亡率的主要感染引起,與更大的負擔在低收入和中等收入國家(中低收入國家的要求)。1在印尼,肺炎導致兒童死亡人數的15%,死亡的第二大原因2017年5歲以下兒童。2印尼實踐指南是改編自世界衛生組織的指導方針,這是基於1970年- 1990年的數據顯示細菌等流感嗜血杆菌b型(Hib)鏈球菌引起的肺炎大多數兒童致命的肺炎引起的。3 - 5因此,經驗抗生素是一線治療兒童社區獲得性肺炎(CAP)。6 - 8盡管有證據表明適當的抗生素救生,合理選擇抗生素治療肺炎受到低遵守指導方針和現場即時診斷不足。9 - 11因此,醫療服務提供者,尤其是LMIC,指出可能overtreat無菌肺炎用抗生素。11日12

最近的一些研究兒童帽的凸顯了病毒目的的作用。增加病毒的識別目的的上限可能是因為增強的分子診斷能力和b型流感嗜血杆菌和肺炎球菌結合疫苗的廣泛部署(PCV)。13日14指出治療無菌肺炎抗生素可能造成可避免的抗菌素耐藥性。因此,當前數據的目的需要兒童肺炎,應定期評估通知疫苗接種政策、經驗管理決策和有針對性的治療。12

從診斷的角度來看,直接展示生物文化(或染色)肺吸入的標準來確定微生物病原學的帽子。15在當今時代,許多生物標本使用侵害(如血,naso /口咽分泌物、支氣管肺泡灌洗或誘導痰())和采用不同的方法(如文化、PCR、抗原檢測或成對血清學)來識別生物。16然而,這種綜合方法成本高,往往需要專門的設備和人力資源,限製在資源匱乏的可行性。17 18

未來的以社區為基礎的群組研究定義病原體(s)導致印尼兒童帽稀缺。我們進行了一次的合作增強參與Research-Pneumonia兒科學(PEER-PePPeS)的研究,旨在確定兒童帽的目的使用綜合診斷方法。

方法

研究設計和研究的網站

PEER-PePPeS多點觀察性隊列研究(ClinicalTrials.gov標識符:NCT03366454)尋求確定目的的兒童帽2-59歲個月印度尼西亞。這項研究是由印尼傳染病研究夥伴關係(INA-RESPOND)和注冊參與者最初三個政府推薦的教學醫院三省:Kariadi醫院(爪哇)Sardjito醫院(日惹)和坦地區醫院(萬丹)所示在線補充文件1)。衛星站點附近的主要網站中加入這項研究促進學科招聘。

研究的定義

在這項研究中,被定義為兒童肺炎咳嗽或發燒至少有下列之一:氣短(由至少一個表示下列跡象:頭部擺動;鼻闊口;胸部吸入或肋間收回),呼吸急促、咕噥,發出爆裂聲,幹羅音,減少水泡呼吸聲音,支氣管呼吸音或胸部x光發現符合肺炎。Tachypnoea被定義為呼吸速率> 50個/分鍾為2 - 12個月內的嬰兒和兒童> 40 /分鍾> 12-60月。19胸部x光發現異常符合肺炎被定義為局灶性或彌漫性浸潤,剪影標誌、胸腔積液或空氣支氣管征。20.胸部x光被兒科醫生閱讀。

基於分類和治療兒童肺炎在衛生設施(2014版本),2-59月齡兒童重症肺炎的定義是肺炎(呼吸急促和/或胸部吸入)伴隨著任何危險跡象,包括不能喝酒,持續嘔吐、抽搐、嗜睡或意識喪失,喘鳴在平靜的孩子或嚴重營養不良。19

研究參與者

PEER-PePPeS研究注冊2-59個月歲兒童,他們住院18 2017年7月和2019年9月25日之間,和肺炎的定義。合格的受試者在24小時內注冊入學。孩子們被排除在外,如果他們已經住院> 24小時;有惡性腫瘤或惡性腫瘤史;長期的曆史(>類固醇治療2個月);或條件,可能會妨礙符合研究過程(例如,病人標本為誰或無法獲得生活以外的地區的後續實際)。

研究過程

人口統計學和人體測量數據,目前的跡象和症狀,妊娠史,預防接種狀況、母乳喂養史,抗生素和類固醇曝光,家族史、病史、風險因素、血液學資料、化學結果和胸部x光片(每標準護理)收集報名。臨床檢查(生命體征,一般檢查,肺部聽診、動脈血氧飽和度);鼻咽拭子(NP)分子測試;是文化和分子測試;采集血液標本進行常規血細胞計數,文化,分子檢測、血清學測試、C反應蛋白(CRP)和原降鈣素(PCT)也被執行。我們每天前瞻性跟蹤對象,直到出院;生命體征數據,呼吸道症狀,重症監護承認,收集插管、並發症和治療。14天,我們進行臨床檢查和血清學測試收集恢複期的血清;受試者出院前14天返回診所的評估。我們進行了一次電話采訪中30天(±4天)來評估臨床結果。

本研究使用一些廣泛使用的細菌和病毒的呼吸道病原體分子麵板和血清學檢測。21 - 24日NP和標本測試PCR麵板,包括12個病毒(甲型、乙型流感、腺病毒、腸病毒,bocavirus,呼吸道合胞體病毒(RSV), RSV B,人類metapneumovirus (hMPV)、鼻病毒、副流感病毒病毒(PIV) 1 - 4,冠狀病毒OC43和冠狀病毒NL63)。NP標本進行了評估采用聚合酶鏈反應對五種細菌(流感嗜血杆菌,鏈球菌引起的肺炎,莫拉克斯氏菌屬複活,金黃色葡萄球菌肺炎克雷伯菌),而九標本測試(流感嗜血杆菌、肺炎鏈球菌、肺炎支原體、衣原體肺炎,百日咳博德特氏菌,莫拉克斯氏菌屬複活,金黃色葡萄球菌,肺炎克雷伯菌軍團菌肺炎)。質量好(< 10鱗狀上皮細胞/低功率12)標本進行了文化和革蘭氏染色劑。25全血,執行qPCR三種細菌(流感嗜血杆菌,鏈球菌引起的肺炎金黃色葡萄球菌)。血清學測試七病毒(甲型、乙型流感、腺病毒、細小病毒B19,艾柯病毒/腸病毒,RSV, PIV)和四個細菌(肺炎支原體、衣原體肺炎軍團菌肺炎百日咳博德特氏菌使用成對acute-convalescent血清)進行。

血培養,是文化和革蘭氏染色劑,常規血細胞計數、c反應蛋白,PCT和胸部x射線進行實驗室/在醫院放射科的網站。qPCR和血清學檢測進行回顧性INA-RESPOND參考實驗室位於縣醫院。細節,血培養、痰培養、分子和血清學測試技術所示在線補充表1

病原體識別

致病細菌、病毒或混合肺炎病原體是決定基於一種算法(PEER-PePPeS規則)微生物的解釋,分子和血清學試驗結果發表之前。12簡而言之,我們認為所有生物檢測到血培養,檢測全血PCR,或者從高質量的標本在大量兼容主要革蘭氏染色劑作為潛在的致病細菌病原體。細菌通常被視為汙染物被排除在外。鼻咽,潛在的殖民細菌(如流感嗜血杆菌,肺炎鏈球菌金黃色葡萄球菌)和潛在的無辜的旁觀者病毒(腺病毒,如bocavirus non-SARS人類浸(hCoVs),腸病毒、鼻病毒)被確定病因基於PCR密度截止和/或血清診斷標準配對急性和恢複期的血清(血清轉化或2 - 4倍增加抗體滴度在恢複期的標本)。12

數據收集和統計分析

數據記錄在紙上情況報表中輸入複製到OpenClinica (OpenClinica,麻薩諸塞州,美國)的研究人員。分類變量概括使用絕對值和百分比,和連續變量中位數和差。使用皮爾遜χ分類變量的差異比較2或者確切概率法當預期值的列聯表細胞低於5。連續變量的差異比較采用單向方差分析或克魯斯卡爾-沃利斯H-test數據並不遵循正態分布基於列文的測試。使用SPSS軟件統計分析23節(IBM)。p值都是雙麵的。水平的意義被設定為p < 0.05。

病人和公眾參與

患者或公眾沒有參與研究設計或研究行為在任何階段從開始到完成這個項目和傳播。患者符合資格的標準如前所述招募了這項研究。

結果

研究人群

住院的444名兒童帽,188(42.3%)都有資格參加這項研究。256年篩選失敗,31.8%是由於住院> 24小時檢查的時候,22.1%的情況下,可能會幹擾研究過程。188年入學的孩子,184例(97.9%)有放射肺炎的證據。179例(95.1%)受試者完成了研究,其中包括19(10.1%)死亡。8(4.3%)的受試者失訪,和一個主題(0.5%)退出了這項研究。研究流所示圖1

圖1

主題篩選,招生和監控流程圖。帽,社區獲得性肺炎;CRP, C反應蛋白;CXR,胸部x光片;PCT,原降鈣素;RR,呼吸速率。

提出了人口和臨床特點表1。年齡,性別,世衛組織實驗室的價值觀和肺炎嚴重程度的分類是相同的三個研究地點。中位數年齡為9個月(差5 - 20),和54.7%的受試者男性。最常見的並存狀況/病史發育遲緩(27.7%),先天性心髒病(26.1%)、低出生體重(24.4%)和嚴重營養不良(18.6%),主題從日惹網站有這些並發症的比例最高。那些接種過疫苗的比例(年齡調整後)對肺炎球菌、流感、Hib-DPT和麻疹疫苗是2.1%,1.1%,分別為55.9%和75.0%。

表1

基線特征的主題

最常見的症狀是呼吸困難(92.6%)、咳嗽(91.0%)和發熱(80.9%)。指出在最初跡象檢查包括肋間收縮(91.0%)、幹羅音(89.4%)和胸部吸入(66.5%)。的188名受試者中,172人(91.4%)和167年(88.8%)CRP和PCT測量值中位數為9.0 (IQR 3.6 - -28.0;裁判範圍≤5)0.2 mg / L和(差0.1 - -1.7;裁判範圍≤0.15 ng / mL,分別。間質浸潤(69.7%)是最常見的影像學發現。47.3%的病例被列為嚴重肺炎根據世界衛生組織的分類係統。所有招生188例使用抗生素治療,其中150(79.8%)已收到1 - 2劑量的抗生素之前收集的血培養應急裝置,與氨苄青黴素和慶大黴素(34.6%)、頭孢噻肟(17.0%)和頭孢曲鬆鈉(14.4%)是三個最頻繁使用的方案。抗生素治療前血培養管理的細節,包括劑量和頻率,提出了在線補充表2

檢測病原體

血液和唾液文化進行標本184例(97.9%)和183例(97.3%),分別為。總共有150(79.8%)兒童接受了抗生素之前收集的血液文化。七十五人(41.0%)痰培養分離分析標本會議所需的質量標準。NP或OP拭子從187年(99.5%)獲得了主題,是PCR從176年(93.6%)、全血為PCR從163年(86.7%)和配對acute-convalescent血清標本進行血清學從116 (61.7%)(圖1)。

PEER-PePPeS算法被用來確定致病病原體(s)與文化、識別的分子和血清學試驗。188名研究參與者中,48例(25.5%)有細菌感染,31例(16.5%)有病毒感染,76(40.4%)的混合細菌和病毒病原學,原因不明,33 (17.6%)(圖2一個)。混合感染,最常見的病因學,被認為在2 - 11個月的38.7%和42.7%的12-59月(圖2 b)。混合感染是主要病因學所有研究網站(在線補充文件2)。流感嗜血杆菌實B (N = 73, 38.8%), RSV (N = 51歲的27.1%),k .肺炎(N = 43歲的22.9%),肺炎鏈球菌15.4%)(N = 29日,流感病毒(N = 25歲的13.3%),金黃色葡萄球菌(N = 20, 10.6%),此外(N = 17日9.0%),hMPV (N = 11, 5.8%),鼻病毒(N = 10, 5.3%)和b .百日咳(N = 7, 3.7%)十大病原體識別,通常出現在混合感染,而不是作為一個唯一的病原體(圖2 c)。流感病毒是顯著的高於12-59 vs 2 - 11個月年齡組(N = 16日64%,p = 0.027),金黃色葡萄球菌更常見的2 - 11個月vs 12-59月(N = 16日80%,p = 0.024)。雖然不顯著,其他病原體趨勢朝著更頻繁的檢測密蘇裏州年齡2 - 11(除了b .百日咳)(圖2 d)。在76例混合感染病例,RSV +流感嗜血杆菌實B是最常見的合並感染(N = 22日28.9%),其次是RSV +肺炎鏈球菌(N = 10, 13.2%)、流感病毒+流感嗜血杆菌實B (N = 10, 13.2%), RSV +k .肺炎(N = 9, 11.8%)和PIV +流感嗜血杆菌實B (N = 9 11.8%)(數據沒有顯示)。

圖2

病原體分布。(A)的總體比例確定病毒/細菌病原體混合,(B)病毒/細菌病原體混合年齡組,(C)的檢測模式的十大發現病原體,(D)分布的十大年齡組識別病原體。* P < 0.05。人類metapneumovirus hMPV,;RSV,呼吸道合胞體病毒。

沒有觀察到不同病原體肺炎嚴重程度分布的基於分類係統(在線補充表3在線補充圖3)。由病原體肺炎嚴重程度之間沒有顯著差異分布狀態或死亡率,除了肺炎鏈球菌這是發現在更嚴重的情況下使用係統(p = 0.033) (在線補充表3)。

比較積極的利率為每個病原的檢測方法所示表2。總的來說,PCR捕獲細菌病原體多文化和病毒性病原體比acute-convalescent血清學配對。成對血清學通常有助於識別典型的細菌,如c .肺炎退伍軍人和上呼吸道病毒、鼻病毒、腸道病毒等。當比較血液和文化,產生了更積極的細菌病原體的結果。同樣,PCR捕獲比NP / OP PCR病原體。

表2

病原體/ PEER-PePPeS規則檢測方法

死亡率

19(10.1%)的188例30天的研究期間去世。7這些19(36.8%)是男性,大多數(N = 17日89.5%)小於1歲的時候。19中死亡主題,研究持續時間中位數為12位差4 - 17.5天;8(42.1%)承認ICU和6(31.6%)接受機械通氣。12(63.2%)死於呼吸衰竭,三個(15.8%)由於敗血症和放電後三(15.8%),原因不明(數據沒有顯示)。大多數死亡發生在2 - 11月年齡組相比12-59莫年齡組(78.9%比21.1%,p = 0.036)。病原體為已故的受試者bacterial-only 7 (36.8%)、viral-only在兩個(10.5%),混合在5(26.3%)和未知的五個科目(26.3%)。在病原體分布沒有明顯差異科目,幸存的死亡。流感嗜血杆菌實B是最常見的病原體中確定死亡主題(N = 8,病死率(CFR)在本研究中為11.0%),緊隨其後k .肺炎(N = 6,病死率為13.9%),流感病毒(N = 3,病死率12.0%),b .百日咳(N = 2,病死率28.6%)和RSV (N = 2,病死率3.9%)(在線補充表3)。預先存在的條件下在已故科目包括先天性心髒病(N = 10, 52.6%),嚴重營養不良(N = 7, 36.8%)和發育遲緩(N = 7, 36.8%)。死亡病例的臨床總結所示在線補充表4

季節性

27個月的研究期間,RSV引起的感染和流感被認為全年峰值活動發生在濕季(11月至3月)在印度尼西亞(66.7%,p < 0.001;分別為和64.0%,p = 0.012)。然而,幾乎沒有變化檢測最常見的呼吸道細菌感染的月和季節。流感嗜血杆菌實B顯示了峰值(N = 12, 16.4%)和8月3月(N = 11, 15.1%)k .肺炎肺炎鏈球菌全年波動在較低水平(圖3)。

圖3

每月數量和分布的(A) (B)感染引起的季節性模式流感嗜血杆菌實B, RSV,肺炎克雷伯菌,鏈球菌引起的肺炎27個月的研究期間和流感病毒。RSV,呼吸道合胞體病毒。

討論

PEER-PePPeS、前瞻性多點研究當前兒童帽的流行病學特征2-59月在印度尼西亞。最近沒有前瞻性印尼研究討論這個主題。我們的研究發現:(1)混合細菌和病毒感染是最常見的(N = 76, 40.4%)導致兒童帽,不分年齡和肺炎嚴重程度;(2)細菌感染(66%的病例)是很常見的流感嗜血杆菌non-b類型,k .肺炎肺炎鏈球菌三種最常見的細菌目的;(3)病毒性病原體也常見PEER-PePPeS科目(57%),16.5%的病例歸咎於病毒隻有RSV病毒和流感病毒是最常見的識別和(4)PCR對病原體標本是最敏感的檢測識別。

雖然我們的研究結果與其他研究是一致的,混合感染的臨床意義仍然是有爭議的。目前還不清楚如果代理商作為真正的病原體。22日26日PEER-PePPeS沒有演示相關的混合感染肺炎嚴重程度和30天死亡率。許多死亡發生在年輕的時候(< 1歲)和並發症,如先天性心髒病、嚴重營養不良,類似於先前的報道。27 28這些因素應該考慮兒童肺炎的預防和管理,以減少死亡率。

近年來,一直專注於增加呼吸道病毒在兒童肺炎的作用,部分歸因於使用共軛Hib疫苗和肺炎球菌和增加PCR的檢測。21日22日29 30在PEER-PePPeS,病毒被發現在57%的受試者隻有+混合感染(病毒),16.5%的病例歸咎於病毒。因此,許多患者可能收到不必要的抗生素覆蓋每當前印尼經驗準則。提高能力區別病毒和細菌感染會促進抗生素的優化管理和應對抗菌素耐藥性。31日

RSV病毒和流感病毒是最常發現在這項研究中,可能與印尼的濕/雨季。尺碼高患病率的RSV也觀察到在加布裏埃爾和鱸魚國際兒童肺炎病原學的病例對照研究。22日30的混合感染,我們發現RSV +流感嗜血杆菌實B和RSV +肺炎鏈球菌是最常見的。因為RSV等呼吸道病毒可以引起繼發性細菌感染,尤其是肺炎鏈球菌流感嗜血杆菌,35反之細菌可以增加RSV易感性,35 36這些合並感染強調需要優化RSV監測、預防和治療。

雖然流感病毒的風險也會增加繼發性細菌感染,是全球兒童發病率和死亡率的主要原因,數據來自發展中國家的稀缺。37在之前的印尼研究住院患者的紗麗,流感病毒的流行率在5歲以下兒童中,10.6%,也從來沒有住院期間診斷。38PEER-PePPeS確認需要改進的診斷策略,管理優化和兒童接種流感疫苗。值得注意的是,我們的研究是在印度尼西亞COVID-19識別之前,39所以沒有地址COVID-19在兒童肺炎的作用。

我們還發現,66%的病例是由細菌引起的感染(細菌隻有+混合感染)。總的來說,流感嗜血杆菌實是最常見的細菌有牽連,緊隨其後k .肺炎肺炎鏈球菌。流感嗜血杆菌實B優勢也觀察到在馬來西亞的一項研究中,90%的入學兒童接種Hib疫苗作為國家免疫規劃的一部分。24與印尼的溫和的Hib疫苗覆蓋率(56.4%),高的發病率流感嗜血杆菌實B可能代表其真實患病率或菌株不是由Hib疫苗。40這一發現non-typeable同意當前數據流感嗜血杆菌(NTHi)可以造成嚴重的疾病,和主張加強兒科診斷實驗室能力。

我們的識別k .肺炎是第二個最常見的細菌性病原學是符合運輸率高(~ 7%)在健康印尼兒童。馬車一直可憐的食物和水相關的衛生,可能引起肺炎,尤其是在兒童營養不良。41鑒於k .肺炎的抗生素耐藥性的潛力和高毒性的一些壓力,主動檢測和管理策略應該優先考慮。42

患病率相對較低(15.4%)肺炎鏈球菌PEER-PePPes奇怪因為運輸率很高,在印尼PCV覆蓋率低。43低流行率也被報道來自馬來西亞,PCV覆蓋率是8.7%24鱸魚的研究,反映出兒童肺炎目的:時態變化。22PEER-PePPeS隻有4.8%的受試者收到PCV,接種疫苗本身並不能占較低肺炎鏈球菌患病率。抗生素暴露樣本采集前可能減少殖民密度和降低了產量肺炎鏈球菌由文化和PCR。44此外,不包括我們的麵板肺炎鏈球菌血清學配對,這可能是有用的提高幼兒肺炎的診斷。45盡管如此,肺炎鏈球菌仍然是一個重要的病原學的全球代理嚴重/複雜的帽。46我們的發現肺炎鏈球菌顯著相關的嚴重病例由世衛組織分類係統支持需要持續的監控,疫苗接種和預防成人和兒童之間的傳輸。

一些病原體識別策略納入PEER-PePPes演示的微分效用分析和標本類型。我們的研究結果強調分子分析的價值,特別是在culture-negative微生物可能在文化不能收回的情況下由於之前抗生素或否則很難培養細菌的存在。47 48PCR也不費力而可以識別與抗生素耐藥性相關基因,雖然傳統文化方法需要確認表型耐藥。49個50即使有限的PCR麵板使用在我們的研究中,分子檢測有更大的敏感性比血或痰培養細菌病原體的識別。

雖然敏感檢測PCR不提供信息關於傳染性或生存能力。基因組片段死去的生物可能會發現,通常在低水平,即使臨床決議。48此外,負麵結果可能發生由於微分沿呼吸道病毒動力學。下呼吸道標本,如,應該尋求來自感染的網站。12日13因此,我們觀察到更高的收益率從PCR比NP標本。我們還發現,使用成對的血清學診斷產量和增加對病原體確認是有用的,特別是在無辜的旁觀者細菌病毒和非典型的設置。12

PEER-PePPeS綜合方法用於病原體檢測診斷產量增加。它還登記病人在27個月的研究期間,季節性的促進評估。然而,我們的研究也有一些局限性。首先,相對比較小的樣本大小,觀察設計可能限製generalisability和因果推論。其次,大多數(79.8%)接受了抗生素的受試者在樣本收集按照國家指導方針。為了解決這個問題,我們注冊入學科目在24小時內,標本收集盡快減少抗生素對文化的影響的結果。第三,我們沒有注冊健康控製孩子,限製的能力估計的調整人口歸因分數每個病原體。29 30健康對照組可以顯示基線運輸率,減小overattribution疾病的非致病性微生物。21日22日29 30第四,我們沒有收集肺吸入物或胸膜液標本,測定優越的肺炎病原學。15第五,一些受試者肺炎的原因不明;這可能是由於抗生素在文化管理可以降低敏感性,是質量差,細菌和病毒病原體的有限板測試,目前缺乏真菌測試,或小兒肺炎的未被發現的原因。

總之,兒童帽的流行病學也在不斷地演變與社會和環境因素,因此,應定期評估。我們的研究發現,流感嗜血杆菌實B和RSV是最常見的病原體導致住院帽在印尼2-59個月大的嬰兒,反映暫時動態兒童帽的目的;研究從1970年代- 1990年代主要發現肺炎鏈球菌流感嗜血杆菌B型,中低收入國家建設兒童肺炎的最重要原因。3 - 5PCR為病原體鑒定證明是最好的靈敏度。我們建議將分子檢測病原體檢測,最好是多路複用醫療點化驗,付諸實踐的指導方針。改進在印尼COVID-19大流行期間的實驗室基礎設施的可用於促進使用分子分析評價兒童帽子。優化病原體檢測理解改變兒童帽流行病學也會告知公眾預防和管理政策。

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倫理批準

本研究通過醫學院倫理委員會批準,印尼(作品567號/ UN2.F1 / ETIK / 2017)。這項研究是進行符合赫爾辛基宣言。書麵知情同意得到父母或監護人在注冊之前。參與者給知情同意參與這項研究之前的部分。

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  • 貢獻者DL、高頻、RT, YM,香港,飛行員,ATA, C-YL和CL和概念化的研究設計。DL、高頻、RT、AB CH, MSA, DW,毫米,SD和臨床評估和執行負責數據輸入。DL、高頻、RT, YM,香港,飛行員,問,正義與發展黨和C-YL設計病原體識別的方法。YM、香港和飛行員執行數據分析、解釋和起草了第一個手稿。DL,香港,ATA,可,C-YL和CL協助文稿寫作、分析和解釋數據。所有作者手稿的發展做出了貢獻,對關鍵conten編輯和批準了最終版本。香港充當擔保人最後的手稿。

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