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客觀的描述個人和地區風險入侵或皮膚和軟組織(SSTIs)金黃色葡萄球菌感染比較耐甲氧西林金黃色葡萄球菌與methicillin-sensitive (MRSA)金黃色葡萄球菌(MSSA);並強調兒童和成人之間的區別。
設置以人群為基礎的研究從21日報告實驗室位於喬治亞州衛生區3 (HD3),一個eight-county在亞特蘭大市區排水區。
參與者一個案例是一個居民HD3從誰金黃色葡萄球菌在2017年被隔離。
主要的結果Culture-confirmed金黃色葡萄球菌感染,歸類為皮膚和軟組織(非侵入性代理)或入侵,由methicillin-sensitivity地位。
結果SSTIs的發病率是19.7/100 000人,相比之下,000年為5.2/100侵入性感染。成人經驗的較高的SSTIs(22.3/100 000)和侵入性感染(6.7/100 000)與兒童SSTIs(13.0/100 000)和侵入性感染(1.3/100 000)。風險MRSA和MSSA SSTIs為兒童和成人類似。黑人患者SSTIs比白人更可能耐甲氧西林金黃色葡萄球菌(兒童(或1.43,95%可信區間1.16到1.76);成年人(或1.24,95%可信區間1.08到1.42))。成人侵入性耐甲氧西林金黃色葡萄球菌更有可能是黑色的(調整或1.69,95%可信區間1.25到2.29)相比,那些入侵MSSA。侵入性耐甲氧西林金黃色葡萄球菌的兒童更有可能從一個種族、民族集中區域(或4.66,95%可信區間1.85到11.71)。熱點在擁擠的地區發現了耐甲氧西林金黃色葡萄球菌的黑人人口的更高的利率。
結論耐甲氧西林金黃色葡萄球菌感染的風險在兒童和成人可以定義獨特的地區社會人口特征是不同的對於那些與MSSA感染有關的區域。實體的風險MRSA和MSSA可以用來開發目標的公共衛生幹預措施來減少傳輸和發病率。
- 傳染病
- 流行病學
- 公共衛生
- 微生物學
數據可用性聲明
沒有數據是可用的。
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來自Altmetric.com的統計
本研究的優點和局限性
使用一個大型實驗室確認的耐甲氧西林的地理數據集金黃色葡萄球菌或methicillin-sensitive金黃色葡萄球菌確定個人和社區社會人口的風險因素。
捕獲的小集群socioenvironmental特征為個人證實感染通過使用可靠的人口普查區的估計。
排除實驗室網站由於不完整的皮膚和軟組織感染相關性數據或缺乏地理情況。
監測在亞特蘭大進行可能不會在美國其他地區的代表。
介紹
耐甲氧西林金黃色葡萄球菌(MRSA)治療和預防感染目前的挑戰在醫院和社區設置。在2017年,估計有323耐甲氧西林金黃色葡萄球菌感染的700例住院病例發生在美國,與600相關的死亡。1醫院的耐甲氧西林金黃色葡萄球菌(HA-MRSA)和community-associated耐甲氧西林金黃色葡萄球菌(CA-MRSA)感染在以前的文獻描述,2 3強調風險入侵HA-MRSA感染(住院,極端的年齡段,男性,黑人種族和血液透析患者)4 - 7和CA-MRSA感染(擁擠、運動設施、軍事個人衛生差,以前的抗生素使用和社會經濟因素(家庭收入較低,醫療水平麵積和麵積與低教育程度))。8 9皮膚和軟組織感染(SSTIs)可能占至少90%的非侵入性CA-MRSA和每年導致超過1400萬步訪問。2 8 - 15盡管證據從2016年的一項研究表明,入侵methicillin-sensitive的發病率金黃色葡萄球菌(MSSA)感染在我們八個縣,在五個州高於侵入性耐甲氧西林金黃色葡萄球菌感染的發病率在所有人群,16數據評估非侵入性MSSA感染更少。
這是第一大比較成人與兒童和以人群為基礎的研究金黃色葡萄球菌,生活在美國東南部。沒有先前的研究兒科實體風險與成年人相比,其中耐甲氧西林金黃色葡萄球菌或MSSA感染。在這項研究中,我們(1)描述個人和地區風險侵襲性感染或SSTIs所致金黃色葡萄球菌比較MRSA和MSSA;和(2)突出兒童和成人之間的差異與這些感染。
方法
研究設計
這是一個回顧性研究使用數據從格魯吉亞新興感染程序(EIP)實驗室監測金黃色葡萄球菌感染21報告實驗室(18基礎和3轉診醫院)位於喬治亞州衛生區3 (HD3) eight-county流域麵積約3 951 039。17美國的這個區域顯示在地圖上在線補充圖1。格魯吉亞的EIP自2005年以來一直持續,但在2017年,一個有時限的擴張其監測發起包括額外的感染,例如,金黃色葡萄球菌。
病例定義
案件被定義為一個居民的HD3誰金黃色葡萄球菌從任何臨床孤立的文化;例MRSA和MSSA區分。標本來源進一步歸類為侵入性,非侵入性感染或其他/不確定基於回顧文化來源。侵入性感染包括隔離金黃色葡萄球菌從通常的網站(如血,骨頭、腦脊液、胸膜液體,心包液、腹水、關節滑液、內髒器官網站(淋巴結、大腦、心髒、肝、脾、腎、胰腺、卵巢或玻璃液)或其他通常的網站)。5非侵入性感染包括那些來自下呼吸道、皮膚膿腫和鼻竇。金黃色葡萄球菌孤立的從其他網站,例如,傷口,皮膚和“未知”網站,評估臨床相關性。“自由文本”和“評論”與文化相關領域被審查的報告傳染病醫生(AW)標本為各自的類別進行分類。SSTIs包括皮膚膿腫和淺表皮膚感染(傷口、皮疹、蜂窩組織炎、棉簽和排水)。在這項研究中,SSTIs代理的非侵入性感染。為每一個獨特的病人,如果多個非侵入性文化發生在14天內或者多個外來文化發生在30天期限內,病例分配作為一個單獨的事件感染(見圖1招生計劃)。
招生計劃為所有金黃色葡萄球菌在成人和兒童文化,基於分布類型的感染(侵入性和非侵入性)和耐甲氧西林,2017。耐甲氧西林金黃色葡萄球菌、耐甲氧西林金黃色葡萄球菌;MSSA, methicillin-sensitive金黃色葡萄球菌;SSTIs、皮膚和軟組織感染。
病人和公眾參與
不適當的或可能的患者或公眾參與的設計、實施、報告或傳播計劃的研究。
患者的立場數據
抗生素敏感性試驗結果和人口特征(年齡、種族、種族、性別和家庭住址)獲得文化的報告。年齡是分為8個臨床相關類別:0 - 2,> 2 - 5,第5 - 13 >,十三至十八>,19-25 > 25-45 > 45 - 65 > 65年。
地理編碼
世界地理編碼服務ArcMap V.10.7軟件(美國加州ArcGIS桌麵,雷德蘭茲:環境係統研究所)是用來georeference普查區水平。
缺失的數據
兩個推薦實驗室數據SSTIs患者被排除在分析由於缺少比賽任務為84.4%和95.5%,分別。剩下21來自13個實驗室,共有429個(2.3%)文化缺失的感染源。年齡,性別,種族和民族失蹤在不到20%的剩餘SSTI和入侵情況。通過五個迭代失蹤人口數據進行調整18基於分布的多個罪名年齡類別、性別、種族、種族、甲氧西林敏感性和郡住宅使用SAS V.9.4 (SAS研究所)。估算人口是用於邏輯回歸和發病率。
地區的數據
區域變量在普查區水平從2017年美國人口普查局的美國社區調查5年數據。
家庭擁擠
美國住房和城市發展部定義家庭擁擠不止一個人每房間居住單元,無論單位大小、結構類型、位置或大小。19
種族差異
基於比例的非西班牙裔白人每普查區個人,這個種族、民族群體集中的地區是由非西班牙裔的比例增加10%,非白人人口的國家。20.例如,在格魯吉亞,非西班牙裔的平均利率,非白人人口是37.8%,所以任何普查區> 47.8%是定義為一個“集中”這個種族、民族群體的領域。
貧困
人口普查大片,> 40%的人口低於國家貧困線。21
其他地區變量
收入不平等指數使用基尼係數來代表財富分散,0表示完全平等和1,完美的不平等。比例在每個普查區沒有健康保險,< 18歲和外國出生(定義為美國人口普查)計算。個人沒有高中文憑的比例計算人口> 25歲。
統計分析
概述
患者符合病例定義對MRSA和MSSA被個別患者的立場和地區社會分層變量。比較事件SSTIs侵入性感染,整體抵抗,被χ然後檢查2測試分類變量和連續變量的兩個示例t檢驗。額外的比較進行兒科和成人之間的感染。發病率計算2017年美國人口普查數據用於研究區作為分母。發病率(每100人000年HD3人口)計算SSTIs和侵入性感染的年齡,種族和民族。統計分析了使用SAS V.9.4 (SAS研究所)。
統計模型
雙變量分析測試協會的變量與MRSA和MSSA相比。個別患者的立場和地區社會人口變量,基於風險或風險的代理在文獻中報道,9日22被選為包容。創建三種類型的多變量邏輯回歸模型:個人因素、地區因素和多級(個人和區)因素。多級邏輯回歸隨機攔截用於普查區;地區變量的p值< 0.15調整模型中包括了最初的考慮。這些模型類型被應用於SSTIs和侵入性感染在兒童和成人。口服補液鹽被用作估計的相對風險,95%獨聯體被確定。所有測試都是正反和p值< 0.05被認為是顯著的。
空間分析
運用以前做的所有數據17為每種情況下和普查區ID確定;項目點的整體匹配的正確率是98%。標準化發病率比(SIRs)使用縣率測定。零事件的觀察普查區調整通過添加一個任意小值(0.5)的觀察和預期事件風險在任何普查區沒有任何感染可能是零。比率計算和映射類型的感染(入侵vs SSTIs),調整年齡和種族。使用Getis-Ord Gi *統計,MRSA和MSSA熱點和冷點分析進行發病率和非聚合數據來確定重要的空間聚類。意義進行了測試在不同的信心水平(99%、95%或90%)為每個空間集群。
結果
在2017年期間,25 335獨特的金黃色葡萄球菌HD3感染被報道。其中,11 746例感染病例被孤立時從源為侵入性感染或不符合我們定義SSTI (圖1)。剩下的感染包括11 331 SSTIs(44.7%)和2258(8.9%)侵襲性感染;3531 SSTIs和220侵入性感染是由於缺少普查區,人口統計信息或不完整的報告推薦實驗室。我們的最終分析包括2915名成人(45.8%)和耐甲氧西林金黃色葡萄球菌SSTIs 3454名成人(54.2%)與MSSA SSTIs,以及525名兒童(36.8%)與MRSA和MSSA SSTIs和906名兒童(63.3%)SSTIs。侵入性感染,722名成人(38.0%)與MRSA和MSSA 1178名成人(62.0%),與32名兒童(23.2%)與MRSA和MSSA 106名兒童(76.8%)。
人口特征
個人人口統計和風險確定先驗所示表1分層,SSTI與侵入性感染(見在線補充表1供歸罪迭代和估算人口在線補充表2,進一步探討人口兒童與成人的差異)。000年HD3 SSTIs發病率是19.7/100,而5.2/100 000年侵入性感染。SSTIs成人經驗的高發病率(22.3/100 000)和侵入性感染(6.7/100 000)與兒童SSTIs(13.0/100 000)和侵入性感染(1.3/100 000)。耐甲氧西林金黃色葡萄球菌SSTIs的發生率(10.2/100 000)是成年人的兩倍以上兒童(4.8/100 000),和侵入性耐甲氧西林金黃色葡萄球菌(2.5/100 000)的發病率幾乎是孩子的九倍(0.3/100 000)。利率的感染類型由耐甲氧西林的人口統計顯示在線補充圖2。
風險因素在兒童和成人
風險MRSA和MSSA SSTIs為兒童和成人類似。黑色人SSTIs人比白人更可能耐甲氧西林金黃色葡萄球菌(兒童(或1.43,95%可信區間1.16到1.76);成年人(或1.24,95%可信區間1.08到1.42)),成人和兒童耐甲氧西林金黃色葡萄球菌SSTIs不太可能是西班牙裔(兒童(或0.76,95%可信區間0.65到0.89);成年人(或0.88,95%可信區間0.78到1.00))(表2)。風險最高的耐甲氧西林金黃色葡萄球菌SSTIs (MSSA)被發現在兒童< 2年,孩子> 2 - 5年和成人> 65年。在區域層麵,由於沒有醫療保險的速度是高度相關的,沒有高中文憑,醫療保險從調整模型。調整後的擁擠和外國出生,更高的比例沒有高中學曆成人耐甲氧西林金黃色葡萄球菌SSTIs的風險增加(或調整(aOR)為2.47,95%可信區間1.29到4.74);生活在一個種族、民族集中地區兒科的風險增加耐甲氧西林金黃色葡萄球菌SSTIs(優勢比1.31,95%可信區間1.03到1.65)未見與成年人。
額外的多級模型分析顯示,黑人不再是耐甲氧西林金黃色葡萄球菌感染的一個重要決定因素在兒童或成人(在線補充表3)。隻有擁擠的關係仍然是一個重要的地區性風險兒科MRSA SSTIs(優勢比1.44,95%可信區間1.02到2.04),雖然擁擠(優勢比1.35,95%可信區間1.14到1.59),沒有高中學曆(優勢比2.98,95%可信區間1.35到6.56)仍然是預測成人耐甲氧西林金黃色葡萄球菌SSTIs顯著區域。
調整後對個人人口統計,成年人與侵入性耐甲氧西林金黃色葡萄球菌更有可能是黑色的(優勢比1.69,95%可信區間1.25到2.29)相比,那些入侵MSSA (表3)。侵入性耐甲氧西林金黃色葡萄球菌的兒童更有可能從種族集中地區(或4.66,95%可信區間1.85到11.71);沒有顯著的區域level-adjusted模型因素侵入性疾病。多層次模型表明成人耐甲氧西林金黃色葡萄球菌(MSSA)侵襲性感染更有可能黑(優勢比1.52,95%可信區間1.21到1.92)和人生活在沒有醫療保險(優勢比3.95,95%可信區間1.07到14.55)在調整了年齡、種族和貧窮。
皮膚和軟組織的空間密度和入侵MRSA和MSSA感染
在調整了年齡和種族,入侵金黃色葡萄球菌(MRSA和MSSA)是分布在人口普查大片比SSTIs少(圖2)。盡管許多人口普查大片SSTIs眾位較高,特別是在中部和北部HD3,最高的入侵先生們聚集在更小的空間區域。更多的人口普查大片眾位> 2.0了耐甲氧西林金黃色葡萄球菌比MSSA SSTIs和侵入性感染,而更多地區的比率1.2 - -2.0兩類型(MSSA感染在線補充圖3)。耐甲氧西林金黃色葡萄球菌在亞特蘭大在富爾頓中南部最大,迪克萊頓縣,三四個縣的人口密度最高。的分布金黃色葡萄球菌成人與兒童相似,除了道格拉斯和牛頓縣有眾位成人高金黃色葡萄球菌但兒科低(圖3 a, B)。更多的人口普查大片SIRs > 2.0被認為有孩子,即使感染成人HD3(覆蓋更大的地區在線補充圖4)。
標準化發病率比(SIR)金黃色葡萄球菌感染、分層類型的感染(侵入性(A)和皮膚和軟組織,(B))。SSTI、皮膚和軟組織感染。
標準化發病率比(SIR)金黃色葡萄球菌感染、分層的成人和兒童(A, B)和熱點和冷點耐甲氧西林金黃色葡萄球菌感染的衛生區3,比較成人和兒童(C, D)。耐甲氧西林金黃色葡萄球菌、耐甲氧西林金黃色葡萄球菌。
在634年的人口普查與成人大片耐甲氧西林金黃色葡萄球菌中,30%(193)被確定為熱點,在這些熱點地區,79%(152 193)在≥40%的黑人和66%的地區(128 193)在熱點地區黑人≥50%。圖3 c, D演示了這些熱點和冷點的優勢在大片白色的人比黑色的人。兒科MRSA熱點是相似的分布作為成年人,熱點出現在33%(166 504)的人口普查大片與兒科耐甲氧西林金黃色葡萄球菌和78%(130 166)和65%(108 166)的這些熱點≥40%和> 50%黑人,分別。總的來說,這似乎與人口密度相對應;例外是柯布和道格拉斯郡。我們發現的證據表明,高度黑色,Fulton-DeKalb縣中南部人口密集地區和亞特蘭大城的南部地區重要的耐甲氧西林金黃色葡萄球菌熱點和少明顯耐甲氧西林金黃色葡萄球菌的熱點地區人口稠密地區的東部和南部迪卡爾布縣。在亞特蘭大的城市的北邊,我們看到沒有明顯的熱點地區,隻有少數重要的冷點。
討論
金黃色葡萄球菌SSTIs發生更多侵入性疾病的成年人(高出近4倍速率)和兒童(約高10倍的速度);這是對MRSA和MSSA一致。因為許多SSTIs不標準或常規培養,我們的發現是真正的低估SSTI發病率和因此,漏報的可能性更大差距SSTIs和侵入性疾病。因為兒童,耐甲氧西林金黃色葡萄SSTIs > 10倍的侵入性耐甲氧西林金黃色葡萄球菌。嬰兒是殖民金黃色葡萄球菌在高達60%,23日這與我們的結果是一致的,兒童(0 - 2年)的風險增加耐甲氧西林金黃色葡萄球菌SSTIs;圍產期殖民加上常見的兒科疾病濕疹或尿布皮炎可能解釋這一發現。
許多研究已經報道了種族/民族差異因為與耐甲氧西林金黃色葡萄感染有關。3 9日22在我們的分析中,我們還發現耐甲氧西林金黃色葡萄球菌感染的速度增加黑人成人和兒童,無論哪一類型的感染;然而,這種差異不再是明顯一旦我們調整的空間集群通過普查區的隨機效應和地區擁擠變量。通過控製實體擁擠,我們證明在社區或地區種族差異水平下降,因為大多數人口稠密的人口普查大片流域包括黑人社區。人口擁擠(家庭或社區層麵)之前一直認為所有的風險金黃色葡萄球菌,無論年齡、性別或種族。22日27因此,預防資源配置,特別是在高水平的家庭聚集的地區,可能會減少耐甲氧西林金黃色葡萄球菌感染的負擔不成比例地影響黑人社區生活在擁擠的設置。
我們觀察到的“拉美裔悖論”耐甲氧西林金黃色葡萄球菌SSTIs兩個拉美裔成年人和兒童。這種保護作用的報道。28 29原因可能是類似於這些因素在其他條件,西班牙人有更好的健康結果(例如,總體而言,拉美裔人在美國生活往往有更好的飲食,降低吸煙率,盡管他們可能生活在貧困和兩倍更有可能沒有保險30.)。文化習俗在大多數社區居民類似的種族可能因為發展中耐甲氧西林金黃色葡萄感染的風險降低。31日32例如,利用率降低抗菌素治療感染,那裏可能是一個文化基礎補救可能間接地降低開發耐甲氧西林金黃色葡萄球菌的風險。進一步研究特定文化的影響是必要的。
區域集中貧困似乎並未MRSA SSTIs的危險因素在社區水平。然而,傳輸動力學SSTIs直接關係到個人的空間距離。我們的研究結果是一致的與他人將擁擠與耐甲氧西林金黃色葡萄球菌SSTIs兒童和成人。22日27大約85%的兒童和成人與耐甲氧西林金黃色葡萄球菌住在擁擠的地區的證據。我們的熱點分析演示了一個“樂隊”在亞特蘭大,從西北到東南逐漸運行,沒有任何熱點或冷點。這個樂隊映射到一個以工業為主的部分很少擁擠。相比之下,其他地區socioenvironmental條件增加了人際傳播的機會(例如,社區與集中複合的住房,k - 12學校,或日托中心居住的兒童和成年人一樣);這些實體因素及其風險的貢獻程度需要進一步調查。
社區與較高的外國出生的人口在兒童和成人預防MRSA SSTIs;然而,在我們調整多級模型,我們沒有看到一個之間的聯係金黃色葡萄球菌感染和較高的外籍居民的地區。Piper詹金斯等還報導說,在國外出生的人在更高的風險MSSA比SSTIs患者耐甲氧西林金黃色葡萄球菌感染的分析在紐約。33調整後為外國出生人口、擁擠和地區“集中”與非西班牙裔白人人口,我們看到的風險增加耐甲氧西林金黃色葡萄球菌SSTIs兒童。還需要更多的研究來檢查更密切的相關性年出生地以外的美國和發展中MRSA和MSSA感染的風險。
修改的健康和健康的決定因素包括收入和教育,隨著收入水平的增加,教育水平通常也會增加,與更好的健康結果。像別人一樣,因此,毫不奇怪,我們看到的風險增加耐甲氧西林金黃色葡萄球菌SSTIs成人教育程度較低。34有限的訪問可靠的信息資源(如互聯網、預防保健的機會或家庭醫療)在預防MRSA SSTIs可能導致這一發現。
有幾個局限性分析,如排除實驗室網站由於SSTI-related不完整數據。此外,數據不能地理可能影響我們的generalisability發現。孩子有經驗更少侵入性感染,特別是耐甲氧西林金黃色葡萄球菌,限製相關的可靠性估計。最後,監視在亞特蘭大進行可能不會在美國其他地區的代表。然而,這項研究的主要力量是使用大量的地理數據集實驗室確認MRSA和MSSA確定個人和社區社會人口風險因素。數據的代表金黃色葡萄球菌在一個多樣的地理排水區,並不局限於一個衛生係統或社區。通過使用信息普查大片,我們捕捉到小集群socioenvironmental特征為個人確診感染。此外,我們評估類別之間的空間關聯性金黃色葡萄球菌感染和使用可靠的人口估計協變量計算。
這個大型的以人群為基礎的分析金黃色葡萄球菌SSTIs和侵入性感染在大型城市顯示的重要性,對比實體風險在兒童和成人相比MSSA感染MRSA。了解地理變異的相關性會導致識別的實體社會經濟和socioecological變量的差異導致MRSA和MSSA感染的風險。我們的研究結果不確定風險在個體層麵,而是基於人口普查區級別的效果和生態環境可能造成的風險年代。葡萄球菌感染。研究結果可以作為發展的基礎有針對性的幹預措施,如減少擁擠或增加股本的醫療資源,地區的重要的基層的風險因素金黃色葡萄球菌感染,雖然調整方法基於年齡和類型的感染。
數據可用性聲明
沒有數據是可用的。
倫理語句
病人同意出版
倫理批準
機構審查委員會批準的這項研究已經在亞特蘭大VA醫學中心(數據收集)和埃默裏大學(數據分析)(機構審查委員會數量:MOD003-IRB00094202)。
確認
作者要感謝以下個人從格魯吉亞EIP:密涅瓦門德斯和琥珀Britton非侵入性的集合金黃色葡萄球菌數據;她的工作在地理編碼所有病人Shanita棚屋;Amy Tunali Rahsaan Overton, Stepy托馬斯的援助對侵入性研究設計和數據收集金黃色葡萄球菌。
引用
腳注
推特@limmergluck
貢獻者擔保人——LCI。研究概念和design-LCI,科幻,鼻中隔黏膜下切除術後DS,。acquisition-SF數據。分析和解釋results-AW,三磷酸鳥苷、TL、AG) LCI科幻,DS。起草手稿preparation-GTP, LCI科幻。所有作者回顧了結果和修改/批準了最終版本的手稿。
資金新興感染程序監測入侵格魯吉亞金黃色葡萄球菌雖然資助美國疾病控製和預防中心(CDC)新興傳染病項目(批準號U50CK000485)。非侵入性的監視金黃色葡萄球菌輝瑞和埃默裏大學之間通過一個協議資助(批準號CP154653)。研究報告在這個出版的部分支持由資金(小靈通格蘭特UL1TR002378)臨床與轉化科學獎勵計劃,國家衛生研究院作為格魯吉亞的一部分,臨床與轉化科學聯盟(格魯吉亞CTSA目前)(原、UL1RR025008、亞特蘭大臨床與轉化科學研究所(ACTSI));格蘭特G12-RR03034數量,美國國立衛生研究院的一個組成部分;格蘭特HS024338-01數量;K-08指導臨床科學家獎,衛生保健研究與質量;格蘭特G08LM013190-0數量,國家醫學圖書館。
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相互競爭的利益沒有宣布。
病人和公眾參與病人和/或公眾沒有參與設計,或行為,或報告,或傳播本研究計劃。
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