條文本

原始研究
糞便標本診斷肺結核的成年人:係統回顧
  1. 薩馬Sultana1,
  2. Sadia Afrin2,
  3. Mahamudul哈桑3,
  4. Adnan二甲胂酸4,
  5. 公裏Saif-Ur-Rahman2,5,6
  1. 1Projahnmo研究基金會,達卡、孟加拉
  2. 2衛生係統和人口研究部門,,達卡、孟加拉
  3. 3世界衛生組織孟加拉國,達卡、孟加拉
  4. 4護理和助產學院理學院、衛生和工程,拉籌伯大學,墨爾本,維多利亞、澳大利亞
  5. 5證據合成愛爾蘭和愛爾蘭科克倫,高威大學,高威、愛爾蘭
  6. 6醫學院、護理和健康科學,高威大學,高威、愛爾蘭
  1. 對應到薩馬博士Sultana;saima.sultana.jhu在}{gmail.com

文摘

客觀的糞便樣本的診斷準確性評估診斷肺結核(PTB)的成年人。

設計係統的回顧。

數據源MEDLINE(奧維德)、Embase(奧維德),科學Cochrane Web數據庫搜索從開始到2023年3月9日- 10 2023年3月使用一個全麵的搜索策略;引用的列表選擇手工檢索相關的文章和相關評論文章。

合格標準選擇研究英文研究報告診斷性能的糞便樣本對呼吸道標本使用分枝杆菌培養、塗片鏡檢或愛視寶化驗診斷肺結核在成人都有資格獲取本係統的審查。

數據提取和合成兩個評論家獨立引文檢索和提取數據的篩選。偏見和適用性的風險結果評估使用診斷準確性研究了工具的質量評估。敘述的數據合成。

結果共有1658名引用被篩選,28全文進行了評估。九個研究符合入選標準。凳子上文化的敏感性和特異性報道21.4%和63.9%之間的不同,分別61.5%和100%。在糞便塗片鏡檢、敏感性和特異性範圍從12.1%到53.9%,分別從79.5%到100%。PCR檢測的敏感性報道,包括愛視寶化驗,範圍從69.7%到100%,特異性69.8%到100%不等。大多數的研究有一個低風險的偏見和較低的在各個領域的適用性問題。

結論這對診斷係統回顧不能得出糞便標本進行成人肺結核診斷的準確性。還需要進一步的研究來評估成人糞便樣本的準確性,使薈萃分析在更新的評論以及其他係統的評論。

普洛斯彼羅注冊號CRD42021245203。

  • 肺結核
  • 細菌學
  • 公共衛生
  • 公共衛生

數據可用性聲明

所有數據都包含在相關研究文章或上傳在線補充信息。

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本研究的優點和局限性

  • 全麵、最新的搜索被執行,嚴格的方法了。

  • 本文隻包括英文文章,這可能導致我們錯過相關的文章發表在其他語言。

  • 顯著的異質性包括研究杜絕薈萃分析的研究結果。

介紹

結核病是一個主要的傳染病的細菌引起的結核分枝杆菌(MTB)。COVID-19大流行之前,它是全球死亡的主要原因由於一個傳染性病原體。1在低收入和中等收入國家,它仍然是排在前十的原因死亡率。2每年,它影響全球約1000萬人,並殺死大約140萬,3大多數患有肺結核(PTB)。4準確的診斷是全球結核控製的一個主要障礙,和誰有優先加強診斷標準及測試。4個5結核病的早期識別是至關重要的,確保最佳的病人護理和治療,包括有效的結核病控製。6盡管結核病診斷測試可用性和最新進展,全球隻有59%的肺結核病例在細菌學上的驗證,1這意味著將近一半的是結核病治療的患者根據臨床症狀,影像學與結核病患者接觸史。因此,迫切需要開發一個迅速而準確的結核病診斷測試。

痰是最常用的結核分枝杆菌臨床樣本和微生物的確認主要是依賴於肺結核診斷痰液樣本。7痰塗片顯微鏡檢查是最廣泛使用的肺結核診斷測試的初級醫療保健設置,8 9在分枝杆菌培養被認為是黃金標準細菌學的確認與藥敏測試(DST)能夠通知適當的治療方案。10核酸擴增檢測,如PCR、實時聚合酶鏈反應(rt - PCR)和loop-mediated放大試驗,可用於結核病的診斷。11日12近年來,愛視寶MTB / RIF,利用rt - pcr,已經廣泛使用在二、三級護理水平與高靈敏度的優點比塗片鏡檢,檢測利福平耐藥性的能力,並提供快速的細菌在1 - 2天內確認。11 13 14此外,世衛組織在結核病的2021合並指南推薦愛視寶MTB / RIF作為最初的診斷測試,而不是顯微鏡,文化和DST為成人和兒童肺結核的症狀和體征。15

這些測試的診斷精度不同的質量和痰中結核分枝杆菌的數量樣品。4此外,肺結核診斷挑戰個人無法咳出痰痰,年幼的孩子中尤其普遍,艾滋病患者,重症和老人。16痰誘導、胃或鼻咽的願望或光導纖維支氣管鏡檢查作為替代方法來收集呼吸道標本個體無法產生咯血痰。這些程序是侵入性的,昂貴的,需要合格的技術技能和設備可能不是現成的,特別是在資源受限的設置。17日至19日因此,非侵入性方法診斷肺結核沒有痰將有利於這些關鍵的患者團體。糞便樣本可以用作呼吸道標本的診斷肺結核的替代品。20.當痰結核分枝杆菌是吞下,通過消化道時,顯微鏡,文化和PCR檢測,包括愛視寶試驗,可以在糞便標本結核分枝杆菌檢測。21日22最近係統評價肺結核診斷兒科患者的糞便樣本上使用愛視寶和其他pcr分析表明與溫和的敏感性和高特異性建議使用糞便樣本作為兒童肺結核的診斷規則測試。第23 - 25世衛組織還建議大便標本結核分枝杆菌愛視寶/ RIF分析肺結核診斷兒童在其2021年的最新更新。15

雖然許多研究評估使用糞便樣本的肺結核診斷成年人已經出版,成年人的效用尚未通過係統分析評估。因此,本係統綜述旨在比較糞便樣本在顯微鏡的診斷準確性,文化和PCR檢測對微生物測試參考標準/ s,如塗片鏡檢、文化或愛視寶化驗使用診斷肺結核在成人呼吸道標本/ s。本綜述的目的是作為一個至關重要的資源信息在成人肺結核的診斷,尤其是在病人提供痰液不足或無法咳出痰痰。

方法

這個方法後進行了係統回顧Cochrane係統評價診斷試驗的準確性26和報告後,首選項報告診斷測試精度標準的係統回顧和薈萃分析。27出版協議詳細描述方法,包括一個搜索策略的製定、篩選數據提取,包括文章的評價質量評估和數據合成。16這個係統評價是在國際前瞻性登記注冊係統評價(CRD42021245203)。

搜索策略和選擇標準

搜索詞、關鍵詞和同義詞,如“結核分枝杆菌”或“百慕大”,“肺結核”或“肺結核”,“結核”或“結核”,“成年人”或“老人”,“糞便”或“糞便”或“糞便”和“診斷”或“診斷”和不同組合的關鍵字被用來開發一個全麵的搜索策略。四個數據庫:MEDLINE(奧維德)、Embase(奧維德),科學Cochrane Web數據庫搜索,沒有日期限製。最初的搜索是在2021年4月進行的,這是更新後的2023年3月9日- 2023年3月10日(最後搜索中可用在線補充文件1)。此外,為了防止丟失的相關研究,參考列表識別研究和相關評論也被搜查了。

研究選擇符合入選標準如下:

  1. 檢查糞便樣本與假定的成年人(18歲以上)/主動PTB使用顯微鏡或文化或PCR檢測(指數測試)。

  2. 肺結核診斷是伴隨著呼吸的結核分枝杆菌細菌確認樣品用文化和/或顯微鏡、和/或愛視寶分析(參考測試)。

  3. 研究設計:回顧性和前瞻性的橫斷麵和隊列研究,隨機對照試驗和病例對照研究,評價肺結核診斷的糞便樣本。

  4. 研究評估診斷準確性和/或提供足夠的數據來生成診斷精度指標(真陽性、假陽性真陰性,假陰性)。

  5. 研究還使用庫存/存儲唾液和糞便標本進行肺結核診斷。

  6. 研究包括成人和兒童,成人數據分類。

研究被排除在外,如果(1)研究參與者低於18年;(2)糞便樣本沒有檢測肺結核診斷;(3)病例報告、評論、會議論文集、抽象、社論、評論和(4)除英語之外的其他語言的文章。

研究篩選和選擇

搜索結果導入Covidence28和重複的文章被刪除。兩個評論作者(SS和KMS-U-R / SA)獨立篩選所有包括文章的標題和摘要按照預定義的合格標準,其次是所有選定文章的全文回顧(SS和KMS-U-R / SA)。通過討論,解決了任何差異或第三個審稿人(MH)谘詢,必要的地方。

數據提取和評估研究質量

數據的抽取,是由兩個獨立審查作者(SS和MH)使用一個預定義的數據收集模板。任何矛盾的判斷進行了討論,解決了第三個審稿人(KMS-U-R)。嚐試拍攝與研究相應的作者/ s通信來獲取額外的數據。

兩個評論家(KMS-U-R和MH)獨立評估偏差的風險和適用性的包括研究使用診斷精度研究的質量評價工具。29日絕不會報道另類評論者之間的協商解決與第三審稿人(SS)。

數據合成

一個描述性的合成進行審查後的目標和結果的措施。無法進行薈萃分析由於異質性包括研究和數據不足。確切的二項式95% CIs計算估計的敏感性和特異性。

病人和公眾參與

一個也沒有。

結果

共有2075名引用被確定通過數據庫搜索。重複被移除後,1658獨立引用。總的來說,1629年引文在標題和摘要篩選中被排除在外,和28綜述了全文。其中,包含九個文章都有資格(圖1)。

圖1

棱鏡流程圖。* *適用多個原因。棱鏡,首選項報告係統評價和薈萃分析。

包括研究的特點

包括在10個國家進行了研究,其中大部分來自亞洲國家,- 343研究來自非洲35-371研究來自歐洲。38其中,四個研究進行了五個結核病高發countries-Bangladesh,34中國32埃塞俄比亞,35泰國和越南,33其中一項研究在高結核/艾滋病毒負擔的國家。37大多數研究(7 9 78%)進行了前瞻性。32-38微生物的數量正(肺結核病人)和負(non-TB健康個體)病例納入研究的範圍從65年到187年,共有998名參與者。兩項研究招募了一批人攜帶艾滋病毒33 35而三個研究沒有參與者的艾滋病毒狀況報告,32 34 38和其他研究人口好壞參半。七個研究使用咯血痰標本類型參考標準和一個研究使用transtracheal吸入痰標本。32參考標準測試變量在整個研究中,六個研究32-37文化作為參考標準,而其他的研究報道相結合的參考標準(如文化和/或塗片鏡檢和PCR)。所有的研究報告不同類型的文化媒體參考標準。六項研究執行所有三個診斷測試(文化、顯微鏡和PCR)糞便標本,30 31 34 35 37 38一項研究僅使用文化33剩下的兩個進行PCR檢測。32個36研究中進行PCR檢測,三個研究結核分枝杆菌表現愛視寶/ RIF化驗,30 32 34其中一個研究使用愛視寶MTB / RIF超(愛視寶超)37剩下的研究使用IS6110等PCR分析,定量PCR,地區差異9-based PCR,轉錄逆轉錄共同反應和結核病分子細菌負荷試驗。在線補充表1總結的主要特征包括研究。實質性的變化也觀察到在糞便處理方法研究在線補充文件2)。

診斷精度的結果

糞便標本文化的敏感性7研究範圍從21.4%到63.9%,其中,研究使用2文化媒體報道分別診斷精度的結果。30 37凳子上文化的特異性變化在61.5%和100%之間。糞便塗片鏡檢的報道敏感性相對較低,從12.1%到53.9%不等的6個研究。相比之下,特異性一致高在大多數的研究中,從79.5%到100%不等。結核分枝杆菌的敏感性和特異性愛視寶/ RIF測定範圍從85.7%到90.6%和93.9%到100%,分別,而報告的愛視寶超敏感性和特異性分別為83.6%和87.2%。其他PCR檢測的敏感性和特異性從69.7%變化到100%和69.8%到97.3%,分別在5研究。的敏感性和特異性,包括研究提出了在線補充表2圖2

圖2

森林情節顯示敏感性和特異性的糞便標本在不同的測試。

包括研究的方法學質量

偏見的風險是高的三項研究為病人選擇域使用病例對照研究設計,31日34不清楚抽樣策略,30.其餘部分有一個低風險的偏見。指數測試和流和時間域,所有的研究被認為有一個低風險的偏見。偏見的風險在其中一項研究還不清楚31日參考標準的領域,因為它是不確定的參考標準結果解釋沒有知識指數測試結果。有低的適用性問題病人選擇,指數測試和參考標準領域所有研究中,除了一項研究31日被判斷為參考標準不清楚適用性問題域。摘要偏見的風險評估包括研究提出了圖3

圖3

總結使用QUADAS-2偏見的風險評估和適用性。QUADAS-2、質量評估的診斷準確性研究了。

討論

結核病是一個主要的全球衛生問題,聲稱每年數以百萬計的生命,導致全球疾病負擔的重要原因。早期正確的診斷是預防結核病發病率和死亡率的關鍵。然而,盡管重大進展在結核病診斷技術和方法,快速和早期診斷肺結核診斷仍然是一個關鍵的挑戰。有關肺結核痰是應用最廣泛的臨床標本檢測,但它擁有一些挑戰收購的痰樣本和診斷測試/ s的性能往往取決於痰標本的質量。4這個係統綜述旨在評估糞便樣本的診斷性能在成人肺結核診斷。

文獻搜索和篩選過程確定了九篇文章符合入選標準。這個係統確定實質性的變化包括研究在研究對象方麵,使用的參考標準和指標測試/ s,包括糞便處理方法。因此,我們不能得出結論的糞便標本進行肺結核診斷的準確率從這個係統的審查。相當大的變化在診斷精度,特別是敏感性,寬與CIs。精度估計這些差異可能是由於不同的包括研究如前所述。然而,發現特異性較高的包括研究與靈敏度估計。此外,在對比觀察之間的差異的凳子文化和塗片鏡檢,PCR檢測包括愛視寶MTB / RIF化驗證明更高的靈敏度(69.7% - -100%)。以前的係統評價和薈萃分析評價糞便樣本的性能在肺結核診斷兒童使用愛視寶MTB / RIF,包括內部分子試驗表明合用的敏感性為67%,2450%23和57%。25Cochrane審查也報道的敏感性為61.5%,特異性98.5%兒科糞便標本進行結核分枝杆菌愛視寶/ RIF,而痰結核分枝杆菌愛視寶/ RIF顯示略高敏感性和特異性為64.6%和99%,分別。39值得注意的是,缺乏標準化協議糞便標本收集和處理也影響診斷產量,尤其是分子化驗,24日25日因此需要進一步調查評估和比較這些不同的表現方法。此外,在凳子上文化可以解釋觀察到的低敏感性,去汙過程之前文化可能會導致的破壞MTB杆菌並導致減少可行的杆狀的負載的文化。之前的研究也表明一個增強的淨化技術包括增加糞便樣本體積來實現更大的診斷產量上廁所文化的肺結核診斷。40三9包括研究被認為是高風險的偏見在病人選擇域由於使用病例對照設計或一個不清楚抽樣法。值得注意的是,所有的包括研究相對較小的樣本大小,這意味著他們沒有足夠的動力來提供顯著的診斷精度估計。盡管樣本量估計在診斷試驗研究取決於數量的指定參數,至少需要300名受試者評估診斷試驗的敏感性和特異性。41因此,未來的研究應考慮適當的研究設計,包括一個更大的樣本容量提供堅實的證據使用糞便樣本。

使用標準化的過程是需要進一步的研究提供準確的估計糞便樣本在成人肺結核診斷通過薈萃分析將是至關重要的證據在結核病診斷景觀早期檢測和初始治療,特別是對於那些無法提供痰標本。使用愛視寶MTB / RIF更多的研究將是有益的世衛組織目前的指南建議使用愛視寶MTB / RIF /塗片鏡檢或培養個人的肺結核症狀和體征。15

我們的係統評價也有一些局限性。首先,包括研究和缺乏數據的異構性質禁止我們執行一個薈萃分析和總結成人糞便標本進行肺結核診斷的準確率。第二,我們隻包括文章發表在英語這可能導致丟失的其他語言編寫的相關文章。然而,據我們所知,這是第一個係統綜述研究糞便樣本的診斷準確性在成人肺結核診斷使用幾個診斷測試,也就是說,文化、顯微鏡和PCR檢測,包括愛視寶MTB / RIF。本文的一個重要力量是使用一個全麵的搜索策略使用多個搜索數據庫來識別所有相關研究。篩選、研究選擇、質量評價和數據提取獨立由兩個審稿人,相比與評估和分歧通過與第三個審稿人討論和協商來解決。

結論

這對診斷係統回顧不能得出糞便標本進行成人肺結核診斷的準確性。還需要進一步的研究來評估成人糞便樣本的準確性,使薈萃分析在更新的評論以及其他係統的評論。進一步的診斷準確性研究標準化的協議和程序批準後產生更多的證據糞便標本診斷肺結核的診斷準確性成年人和將來進行薈萃分析評論。

數據可用性聲明

所有數據都包含在相關研究文章或上傳在線補充信息。

倫理語句

病人同意出版

確認

作者(KMSUR SA)願意承認的貢獻目前捐助者提供無限製的支持位於b包括:孟加拉國政府、加拿大、瑞典和英國。我們感激地承認這些捐助者的支持和承諾,位於b的研究工作。

引用

補充材料

腳注

  • 貢獻者黨衛軍概念化和設計這個係統綜述。SS和KS-U-R搜索策略。黨衛軍,KS-U-R和MH和報告數據獲得的。SS和SA開發出初稿,從AA修正。所有作者回顧了手稿和提供知識的輸入和批準了最終版本。黨衛軍是擔保人的審查。

  • 資金作者並沒有宣布具體資助這項研究從任何公共資助機構,商業或非營利部門。

  • 相互競爭的利益沒有宣布。

  • 病人和公眾參與病人和/或公眾沒有參與設計,或行為,或報告,或傳播本研究計劃。

  • 出處和同行評議不是委托;外部同行評議。

  • 補充材料此內容已由作者(年代)。尚未審查由BMJ出版集團有限公司(BMJ)和可能沒有被同行評議。任何意見或建議討論僅代表作者(年代)和不了BMJ的支持。和責任起源於BMJ概不負責任何依賴的內容。內容包括任何翻譯材料,BMJ並不保證翻譯的準確性和可靠性(包括但不限於當地法規、臨床指南,術語,藥物名稱和藥物劑量),和不負責任何錯誤或遺漏引起的翻譯和改編或否則。