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文摘
背景越來越多的興趣的潛在效用分子診斷在改善危及生命的感染的檢測(敗血症)。LightCycler®,解剖快是一個multipathogen probe-based實時PCR係統針對DNA序列的細菌和真菌存在於血液樣本在幾個小時內消失。我們報告的協議發表的第一個係統回顧臨床診斷準確性的研究這項技術相比,血培養的設置懷疑敗血症。
方法/設計數據來源:Cochrane係統評價的數據庫,數據庫的抽象的評論影響(敢)、衛生技術評估數據庫(HTA), NHS (NHSEED)經濟評價數據庫,Cochrane圖書館、MEDLINE、EMBASE, ISI的網絡科學、生命現象預覽,MEDION和積極研究情報設施數據庫(ARIF)。研究選擇:診斷準確性的研究比較實時PCR技術與標準文化結果上執行一個病人的血液樣本在膿毒症的管理。數據提取:三個審稿人,工作獨立,將決定水平的證據,方法學質量和標準數據集相關統計數據和診斷精度指標為每一個研究。統計分析/數據合成:異質性的研究將使用耦合的森林調查情節接收機的靈敏度和特異性和散點圖符(ROC)空間特征。二元模型的方法將被用於評估總結敏感性和特異性。作者將調查報告偏差使用漏鬥圖基於不對稱的有效樣本量和回歸測試。子群分析計劃為成人、兒童和感染設置(醫院和社區)如果足夠的數據了。
傳播建議將衛生部(HTA報告作為開放的一部分)實時PCR技術是否有足夠的臨床診斷準確性可能前進功效測試期間提供常規臨床護理。
登記PROSPERO-NIHR潛在的係統評價(CRD42011001289)。
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來自Altmetric.com的統計
文章總結
文章重點
描述計劃的係統回顧,旨在確定一種新的實時PCR技術的診斷準確性(LightCycler®解剖快),旨在探測bloodborne病原體的威脅生命的感染(敗血症)的設置。
強調未滿足的需要準確和迅速感染診斷的危及生命的感染(敗血症)。
關鍵信息
這項研究將提供第一次獨立係統綜述的臨床有效性的研究多路實時PCR技術旨在檢測循環病原DNA直接從血液的設置疑似危及生命的感染(敗血症)。
基於這項研究的結果,獨立的建議將使英國健康部門,以幫助確定是否實時PCR技術有足夠的臨床診斷準確性前進功效測試期間提供常規臨床護理。
優勢和局限性
係統評價是關注一個公司產品(CE)標誌實時PCR技術設計用於在危及生命的感染(敗血症)的設置
係統回顧非商業和計劃係統的多學科小組專家、代表工作的關鍵利益相關者在國有化醫療保健係統。
目前臨床感染的診斷參考標準可能沒有各臨床診斷精度高,與所有的感染
介紹
膿毒症是一種由貪婪導致的臨床綜合征宿主感染的係統性炎症反應。1嚴重時,它是伴隨著相當大的死亡率和重大國際醫療保健問題。2確認感染敗血症需要客觀證據,3其中應該包括在微生物鑒定病原體從血液樣本的文化生活技巧。34然而,文化總前幾天一個積極的結果是可用的和至少5天來確定,一個標本是文化負麵的。5這個時間分離初始臨床懷疑和確認感染經常導致有效的廣譜抗生素的早期和持續交付旨在覆蓋最可能的病原體作為“安全第一”的策略,因為適當的抗菌素治療延遲與死亡率增加有關。67不可避免的結果是不必要的抗生素處方,與抗菌素耐藥性的發展(如耐甲氧西林金黃色葡萄球菌)艱難梭狀芽胞杆菌感染以及一係列可避免不利影響,和收購成本,抗菌藥物的使用。8這是由一個缺乏時間關鍵型感染較高的特異性生物標誌物在急救護理9壓倒性的係統性炎症的身體是一種常見的發生,通常不是由感染引起(如,它可能是由於外傷、輸血、胰腺炎)。10因此迫切需要發展技術,可在數小時內提供準確的診斷信息的臨床症狀出現,所以允許更合理的使用抗生素治療的初期階段。
越來越多的興趣可能實時PCR技術來解決這一問題的基於病原體的能力來檢測微量DNA在病人的血液樣本結果4 - 6 h內可用。11概念證明的研究主要集中在兩種方法使用PCR基因擴增與(1)廣泛和通用引物檢測細菌或真菌的DNA,緊隨其後的是物種識別使用post-PCR技術例如基因測序或電噴霧質譜或(2)使用導致的物種的雜交探針提供直接確認。12直觀的後一種方法似乎有最大的臨床效用假設可以建立一個適當的病原體麵板。
雖然這些技術的實驗室分析的敏感性和特異性病原體檢測的DNA血液中被評估,12還有一個承認缺乏臨床試驗數據定義在患者的診斷可靠性測試開發一個係統性炎症反應由於疑似感染。這部分是由於缺乏標準化技術平台,滿足臨床診斷接受監管標準。
解剖快,GmbH是一家由羅氏診斷曼海姆,德國和其上運行實時PCR儀(LightCycler®),是第一個實時PCR係統獲得公司產品(CE)馬克在疑似血液感染病原體探測和識別1213到目前為止,大多數集中在臨床調查群組研究。係統使用多路複用的方法,它允許檢測25最常見的病原體種類導致一個血液樣本(血液感染表1)。病原體的識別是基於物種特異性探針的使用目標之間的內部轉錄間隔區地區16歲和23個年代的地區之間的細菌和核糖體DNA 18歲和5.8 s核糖體的真菌基因組區域。這個實時PCR技術已經廣泛在實驗室級別評估臨床分離株和顯示優秀的分析特異性和排他性,確認其分析的有效性。13歐盟注冊研究(未發表),作為ce標誌的過程的一部分,調查278名疑似危重患者膿毒症來自丹麥、德國和意大利。羅氏診斷報告,分子測試賦予高的診斷特異性和3 - 10倍高靈敏度與傳統相比血培養技術。本研究以來,眾多商業已報告臨床診斷研究,主要集中在懷疑敗血症。此外,一個大型的、獨立的、多中心、三水平臨床診斷準確性研究實時PCR技術目前正在招聘14作為我們詳細的一部分國家衛生研究所(NIHR)衛生技術評估(HTA)資助的項目評估實時PCR技術在膿毒症的診斷、治療和結果。少量的更新目前新興的ce標記PCR技術也能夠檢測病原體的DNA在血液樣本不需要迅速pre-culture,要麼使用一個all-pathogen方法不同時物種形成(如SepsiTest;Molzym GmbH是一家現代化、不來梅、德國)或通過使用多路複用的方法基於多種病原體麵板(如VYOO;德國耶拿,SIRS-LAB GmbH)。與之相比,解剖快,當前的臨床診斷研究使用這些技術是非常有限的。因此,在這個時候,我們獨立在HTA臨床研究的一部分,14我們在這裏描述的協議係統回顧集中在診斷測試的準確性LightCycler®解剖快病原體檢測和識別可疑膿毒症患者的血液中。這個係統回顧已經注冊PROSPERO-the NIHR國際準注冊的係統評價(CRD42011001289)。15
方法
入選標準的研究
參與者
疑似患者的膿毒症的發展,包括成人和兒童,他們需要血培養無論他們關心被交付,並包括疑似社區或醫院獲得感染。
目標的條件下
膿毒症,包括嚴重膿毒症和膿毒性休克。16
指數測試
LightCycler®,解剖快的指數測試血液細菌和真菌病原體的檢測和識別。13
比較器測試(參考標準)
血培養作為參考測試和支撐日常臨床實踐。5所有診斷指標都將使用這個參考標準報告。很明顯,這個標準可能有局限性,特別是在並發抗菌治療的設置。然而,我們不知道這個問題的嚴重程度甚至研究是否有故意包含或排除這樣的病人。在缺乏簡單,國際商定的方法目前另一種參考標準,我們認為這是最可靠的方法,是目前使用一致的方法在此設置獨立HTA臨床研究。14
類型的研究
我們將包括任何臨床診斷準確性的研究,比較了指數實時PCR測試與標準文化結果上執行一個病人的血液樣本在膿毒症的管理。
搜索的方法識別研究
電子搜索
我們將搜索Cochrane係統評價的數據庫,數據庫的抽象的評論影響(敢)、衛生技術評估數據庫(HTA), NHS (NHSEED)經濟評價數據庫,Cochrane圖書館、MEDLINE、EMBASE, ISI的網絡科學、生命現象預覽,MEDION和積極研究情報設施數據庫(ARIF)。CE標記指數在2006年1月宣布測試;因此,該係統綜述將從這個日期在人類隻考慮出版物。沒有語言的限製在電子搜索試驗。
搜索詞/搜索策略
特定的搜索策略將為每個電子數據庫開發,開始與MEDLINE (表2)。MEDLINE策略將改編為每個後續的數據庫和搜索數據庫之間收益率報道,相比。
其他資源
向後跟蹤將由手動搜索所有相關文章的參考書目中發現的電子使用關鍵字“Sepi向前搜索和跟蹤Fast的ISI引用指數和穀歌學術搜索和搜索使用Web會議論文集ISI科學學報(2006年至今)。我們將請求參考列表被索引的唯一製造商測試(羅氏診斷)和臨床診斷準確性收集的數據包括公共羅氏診斷申請CE標誌。此外,我們將尋找未發表的研究和正在進行的試驗涉及的解剖快平台在以下在線注冊:http://www.nlm.nih.gov/hsrproj,http://www.controlled-trials.com/mrct/,http://portal.nihr.ac.uk/Pages/Portfolio.aspx和http://www.who.int/trialsearch合格試驗,確定相應的作者和內容專家聯係來識別潛在的相關研究和相關數據。
數據收集和分析
選擇的研究(英國索爾福德)
最初選擇的標題和摘要將進行兩個獨立審查作者(CW和PD)使用上麵的入選標準詳細。所有的全部論文摘要視為合格(任何評論家)將獲得和閱讀在審查決定他們的包容。分歧在每一步將解決兩者之間的討論評論作者(PD和連續波)和第三作者(GW)。
數據提取和管理(英國貝爾法斯特和沃裏克)
提取一組標準的數據將為每一個研究使用一個定製的數據提取形式包括上麵的入選標準詳細信息,評估證據級別使用牛津大學循證醫學中心水平的證據17和額外的信息,包括:研究設計;臨床(社區、急診、住院、急救護理和通用/專家);參與者人口;臨床特征包括人口(疾病病因學);並發處理(抗菌素治療);參考標準的方法,包括汙染率;支持測試結果(文化除了血液樣本);指數測試設置(醫療點、near-patient、臨床或研究實驗室,批處理和個人分析);報道指數測試實驗室失敗;失蹤的參與者數據; 2 by 2 table of results for primary outcome and reported diagnostic accuracy metrics; Follow-up (eg, survival and length of intensive care and hospital stay).
三個審查作者(DFM、RM和GDP)將獨立提取數據,和任何差異將通過討論或在必要時通過協商來解決第四作者(BB)。
統計分析和數據合成
數據為2×2表的索引測試參考標準將從每項研究中提取。最初,這些將策劃作為一個耦合的森林圖的敏感性和特異性,並在中華民國空間散點圖(繪製敏感性對1−specficity為每一個研究)。這將確定異質性的任何問題。總結敏感性和特異性將使用二元模型估計方法19因為ce標記指數測試是一種半定量實時PCR技術和報告結果為同一閾值的積極性。
調查的異質性
我們將調查病人的影響特征(例如,膿毒症的病因學)和感染收購(社區、醫院)在測試性能將不納入如果足夠的個人研究確定擬合模型。
敏感性分析
我們將探討缺失的數據使用範圍的潛在影響的假設。這將包括兩個失蹤的參與者的影響包括研究和數據缺失的數據從研究沒有提供數據的形式,可以提取並包括在分析中。
亞組分析
如果足夠的數據可用,我們將計劃兩個子群分析成人和兒科人口以及醫院和社區獲得性感染。
評估報告的偏見
如果有足夠的研究納入分析,我們將調查報告偏差使用漏鬥圖基於有效樣本量和回歸測試的不對稱,Deeks和他的同事們推薦的。20.
討論
血培養技術中心的循證指南的調查和治療膿毒症患者。盡管文化精製在上個世紀,仍然是不夠時間至關重要,不能協助管理決策,將不可避免地導致浪費和過度治療有潛在危險的抗菌化療。pcr技術已成為標準的實驗室技術在過去二十年中,可以提供真正的機會病原體檢測的靈敏度和速度的危及生命的臨床感染。LightCycler®,解剖快是第一個PCR進行病原體檢測係統獲得ce標誌和識別在血液樣本,到目前為止,是最深入研究多路實時PCR試驗在膿毒症的臨床設置。我們計劃係統綜述的目的是確定,第一次,這個實時PCR技術的臨床診斷準確性的NIHR-funded HTA設置這項技術的潛在的威脅生命的感染。基於非商業係統綜述的結果,建議將獨立的國家衛生服務提供者是否LightCycler®解剖快有足夠的臨床診斷準確性前進效力和有效性測試期間提供常規病人護理。
確認
我們感謝海倫McEvoy夫人,曾在曼徹斯特大學的醫學院的圖書館,為她幫助搜索策略設計和瓦萊麗夫人,索爾福德皇家NHS信托基金會圖書館和信息資源中心,為她的建議使用過濾器在診斷搜索策略。
引用
補充材料
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補充數據
僅這個web文件已經由英國醫學雜誌出版集團從一個電子文件提供的作者(年代)和沒有對內容進行編輯。
在這個數據補充文件:
- 數據補充-手稿文件格式的pdf
腳注
引用:黑便士,威爾遜C, B布萊克伍德,等。的準確性LightCycler®解剖快探測和識別的疑似膿毒症患者的血液中的病原體:係統回顧協議。beplay体育官方手机版2012;2:e000392。doi:10.1136 / bmjopen - 2011 - 000392
資金PD和GW的部分英國衛生技術評估(HTA)項目的國家健康研究所的格蘭特在HTA 08/13/16 NIHR數量。連續波是由大曼徹斯特全麵支持這個項目的本地研究網絡的工作。DFM和GDP從重症監護基金會(英國)獲得資金支持他們的角色作為國家研究董事。這些資助機構或者任何商業組織已經導致了研究設計;收集、管理、分析和解釋數據;寫的報告或提交報告出版的決定。隻有指定的作者對這些活動的最高權力。
相互競爭的利益一個也沒有。
貢獻者PD和GW發起這個項目,連續波和BB一起工作在最初的架構評審專家從GW分子診斷輸入,急救護理和臨床試驗輸入從PD, DM和GDP,微生物從SG輸入從RM和統計。PD起草協議。所有作者批判了初稿,導致最後的手稿的生產及其後續修訂。
出處和同行評議不是委托;外部同行評議。