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摘要
簡介疾病模型可以成為決策者為其決策提供信息的有用工具。它們可以幫助在不進行臨床試驗的情況下估計幹預措施的成本和收益，並有助於將臨床試驗的結果推斷到人群水平。
性傳播感染並不是孤立發生的。冒險行為和生物相互作用可增加個人同時感染一種以上性傳播感染的可能性。
目前，很少有性病模型考慮合並感染或性病之間的相互作用。我們的目標是識別和總結兩個或多個性傳播感染的STI模型，並描述它們的建模方法。
方法與分析2018年11月27日檢索了6個數據庫(Cochrane、Embase、PLOS、ProQuest、Medline和Web of Science)，以確定重點報道至少兩種不同性傳播感染的方法和模型質量的研究。所有符合條件的研究質量將使用Kopec公布的百分比量表進行評估等．我們將總結所有用於在一個模型中模擬兩種或更多性傳播感染的方法。係統評價和元分析優先報告項目(PRISMA)框架將用於報告所有結果。
倫理與傳播這項係統評價不需要倫理批準。這項研究的結果將發表在同行評議的期刊上，並在適當的會議上發表。本文的研究結果將用於指導新的多sti模型的開發。
PROSPERO注冊號CRD42017076837。
- 性醫學
- 衛生信息學
- 衛生經濟學
- 傳染病
這是一篇開放獲取文章，根據創作共用屬性非商業(CC BY-NC 4.0)許可證發布，該許可證允許其他人以非商業方式分發、混音、改編、在此作品的基礎上進行構建，並以不同的條款許可其衍生作品，前提是原始作品被正確引用且使用是非商業性的。看到的:http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/
數據來自Altmetric.com
本研究的優勢和局限性
這篇綜述將總結用於在單一疾病模型中模擬兩種以上性傳播感染(STIs)的方法。
這一綜述並不局限於某一種建模方法或幹預。
重點總結不同的技術來模擬相互作用的性傳播感染，排除性傳播感染與非性傳播感染的潛在相互作用。
簡介
疾病模型
疾病模型試圖將複雜的主題簡化為感興趣的單個方麵。例如，計算疾病模型檢查疾病在相關人群中的傳播，並推斷潛在幹預可能對該人群產生的經濟影響。1 2隨著計算能力的不斷增強，疾病建模已成為為醫療保健決策提供信息的重要方法。3.
要建立一個疾病模型，可以使用專門的建模軟件(如TreeAge4)或更通用的軟件(如Excel5)可以使用。專門的建模軟件具有更大的功能，而非專家用戶更熟悉通用軟件，這意味著從模型中獲得結果的計算時間更長。6
一般來說，疾病模型可以用不同的維度來描述。以下各段將解釋描述疾病模型的最重要維度。
有兩種方法:基於個體的疾病模型和基於區域的疾病模型。基於個體的模型在計算上更加密集，因為它們模擬建模隊列中的每個人，而區室模型著眼於在疾病模型中處於相同健康狀態的隊列的比例。該模型的建模個體能夠相互作用，這有助於對傳染病進行建模，但在計算上比不相互作用的人群建模更強烈。1 7
疾病模型的隊列可以是開放的，也可以是封閉的。在建模過程開始時定義了一個封閉隊列，在模擬過程中沒有新的個體可以進入封閉隊列模型。開放隊列模型允許新的個體進入模擬，也就是說，保持模擬隊列在相同的規模，因為建模個體可能在建模期間死亡。8
疾病模型可以以多種方式處理時間。例如，馬爾可夫型模型以基於日曆的方式模擬時間，因此時間總是以固定長度的步驟進行，也稱為周期。時間也可以基於事件來處理，這意味著模型跳過什麼都沒有發生的時間段，從一個事件繼續到下一個事件。8 - 10
不同的建模方法可能適合回答不同類型的問題，這取決於建模設置。1
性傳播感染
性傳播感染是主要通過性接觸傳播的傳染病。感染性傳播感染有許多人口、行為和生物方麵的風險因素，包括改變伴侶關係的比率、避孕套的使用和年齡。11由於這些風險同樣適用於所有性傳播感染，患有一種性傳播感染的人可能同時患有另一種性傳播感染。
還有生物學證據表明，一種性傳播感染的存在會損害組織的完整性，從而使患者更容易同時感染另一種感染。12日13
疾病建模和性傳播感染
自20世紀80年代中期以來，性傳播感染的疾病模型一直在使用。已經對衣原體和淋病等單一性傳播感染模型進行了係統綜述。14日15其中一些單一的性傳播感染模型已經為英國的國家衣原體篩查計劃等政府政策提供了信息。16
理論基礎及研究目的
存在許多疾病模型來檢查單一的性傳播感染，這就是為什麼開發這種模型的方法有很好的證據。1 3然而，一些幹預措施可能同時對幾種性傳播感染產生影響。例如，增加避孕套使用的幹預措施已被證明可以降低性傳播感染的患病率，17 18而Cochrane並沒有發現顯著的證據表明增加避孕套的使用會降低性傳播感染的傳播率。19這種模棱兩可的情況強調了在STI模型中包括一種以上感染的重要性，以進一步研究同時針對一種以上STI的幹預措施的潛在影響。我們的目的是總結至少兩種不同性傳播感染同時建模的文獻，並報告這些多性傳播感染模型的方法和質量。
登記
本綜述已在健康和社會護理前瞻性注冊係統評價國際數據庫中注冊，注冊號:CRD42017076837https://www.crd.york.ac.uk/PROSPERO/display_record.php?RecordID=76837）.
方法與分析
合格標準
入選標準
文章將包括以下情況:
報告疾病模型是本文的主要目的之一。
在人群或隊列水平上檢查性傳播感染，以描述疾病的傳播情況。
涵蓋兩種或兩種以上不同的性傳播感染。
包含英文標題和摘要。
其他特征納入標準
研究類型:政府文件，期刊文章，臨床試驗與建模組件和論文。
人群:性活躍人群(或其亞群)，至少檢查水平性傳播感染。
幹預:任何形式的幹預。
排除標準
下列物品將被排除:
沒有提供足夠的細節來提取相關的輸出(在線補充附錄A)，重現模擬方法。
關注性傳播感染以外的疾病，例如癌症、糖尿病或結核病。
檢查性傳播感染與非性傳播感染的相互作用。
隻檢查一種STI，即使模型涵蓋了同一STI的不同菌株。
檢查性傳播感染及其後遺症的聯係，例如，從艾滋病毒感染發展到艾滋病，而不考慮其他性傳播感染。
其他特征排除標準
研究類型:定性工作和個案報告。
人群:僅考慮垂直傳播。
學習類型
研究的重點是建模研究，其中也包括健康經濟分析。由於我們想要提取更多的信息，所以隻能包含旨在詳細報道疾病模型及其發展的文章。至少要檢查的研究的目標之一應該是模型或模型開發過程的詳細描述。
將包括任何回顧多sti建模研究的參考文獻。我們會把上述的模型研究加入篩選的文章中。
有模型組成部分的臨床試驗將包括在內，並有足夠詳細的報告。
政府文件和論文將包括在內。
任何其他類型的出版物，例如病例報告或定性工作，將被排除在外。
人口
模特必須關注人群中性活躍的部分。那些隻關注性活躍人群子群體的模型，如同性戀男性、性工作者或年輕人也將被包括在內。
這篇綜述的重點是研究水平傳播的文章，例如通過性接觸。如果一篇文章隻是模擬垂直傳播，即母嬰傳播(先天性傳播)，將不納入審查。如果一篇文章考慮了水平和垂直傳輸，它將被納入審查。我們將包括各種水平傳播的研究。這也可能是性傳播感染的非性傳播，例如通過共用針頭。
幹預措施
相關的模擬研究可以研究各種不同的幹預措施，例如篩查、治療或行為改變方法。這篇綜述的目的不是研究某種類型的幹預。它將研究能夠同時模擬至少兩種性傳播感染幹預措施的模型。因此，報道任何幹預模型的文章將被包括在內。
如果研究不考慮任何具體的幹預措施，而隻是引入一個具有同時檢查幾種性傳播感染能力的通用模型，則這些研究將被包括在內。
結果
我們希望對多性傳播疾病模型以及用於實現這些模型的方法進行概述。因此，我們將提取以下信息:
造型的方法。
實體的水平。
開放隊列與封閉隊列。
交互作用與非交互作用的種群。
時間處理。
數據來源。
隊列的大小。
時間範圍。
造型軟件。
列入性傳播感染名單。
交互。
性傳播感染後遺症清單。
幹預措施。
經濟組件。
研究進行的年份。
輸入。
的國家。
輸出。
Customisability。
數據項“output”將捕獲給定模型可以計算的不同輸出。這些可以是經濟結果，如“預防每例感染的成本”或“獲得每例QALY的成本”或其他數字結果，如“感染總數”。所有可在模型中輸入或已被研究人員使用的參數都使用“輸入”數據項進行捕獲。我們還將捕捉“輸入”參數可以修改的程度，如果/當有額外的證據可用或修改模型以檢查不同的研究問題。這將在“customisability”數據項中捕獲。所有數據項和包括它們的原因都在網上更詳細地報告補充附錄A．此外，識別研究出版年份、作者、標題和期刊的數據將被捕獲。
信息來源
將使用以下數據庫來搜索疾病模型:Cochrane、Embase、PLOS、ProQuest、Medline和Web of Science。灰色文獻將使用OpenGrey和紐約醫學院灰色文獻報告進行搜索，以查找其他材料。會議記錄將使用Web of Science和Embase找到。博士論文將使用ProQuest、Web of Science、OpenGrey和DART-Europe門戶網站進行搜索。
我們不會聯係作者了解信息不完整的論文，因為我們將文章中所提供信息的完整性作為質量指標。文章中提供的細節應該足以理解和評估所描述的模型。
在開始標題和摘要篩選之前，進行了試點搜索，以查看搜索詞是否產生了所有已知的關鍵文章。如果沒有找到潛在相關的文章，我們會修改搜索策略。
搜索策略
搜索策略適應不同的搜索引擎和數據庫，以適應它們的語法。所有版本的搜索策略都可以在網上找到補充附錄B．總的搜索策略分為三個主要領域:“疾病模型”、“性傳播感染”和“交互特征”。對於每個領域，都開發了一個單獨的搜索詞。這些搜索詞是用“AND”組合起來的。
搜索詞設置為具有高靈敏度，以避免錯過潛在的重要文章。然而，搜索詞具有較低的特異性，這將通過手動篩選不相關的搜索結果來彌補。
搜索工作於2017年11月27日進行。
選擇過程
所有參與文章篩選和數據提取的研究人員將在開始篩選/數據提取之前參加一個會議，以形成對納入和排除標準的共同理解，並協調他們對問題的理解。
兩名審稿人將獨立進行標題和摘要篩選，FS篩選所有文章，另一名審稿人篩選20%。在標題和摘要篩選過程中，審稿人不會知道研究的年份、作者和研究發表的期刊。產生的衝突將由RH解決。如果第二和第三名審稿人發現第一名審稿人過於排他，遺漏了一些論文，我們將增加兩名審稿人審稿的論文比例10%，並重複這一過程。
所有符合全文篩選條件的文章將由兩名審稿人獨立篩選，FS篩選所有文章，另一名審稿人篩選20%。RH將解決任何衝突。
數據提取將由兩名研究人員獨立完成。如果出現任何衝突，將召開會議以尋求共識;如有必要，這將由RH調節。
係統評價和元分析框架的首選報告項目將用於係統地報告結果。20.
質量評估
我們將檢查納入的疾病模型的質量。質量將采用百分製進行評估。21在這個百分比量表中，模型的質量在17個維度中進行檢查，這些維度分為5類:
概念模型。
參數。
計算機實現。
來自模型性能檢驗的證據。
來自檢驗基於模型的決策後果的證據。
每個維度都可以分為“無”(=0分)、“部分”(=1分)或“完整”(=2分)。如果分數的某些維度不適用，則該特定維度將不包括在計算中。在模型的所有適用維度上的所有點的總和除以模型可以達到的總分，以計算作為質量指標的百分比。
偏差的評估
我們將使用標準的統計方法，檢查已發表的模型是否傾向於報告所檢查的幹預措施的積極效果，以便我們可以發現潛在的發表偏倚。
分析
所有經評審的研究將在最終報告中報告，包括其計算出的質量評估值百分比量表。
我們將報告每種建模方法的使用頻率以及每種建模方法的平均百分比比例有多高。我們將報告進行這項研究的年份分布，以了解多sti建模的潛在趨勢。
為了了解哪些性傳播感染相互作用是最相關的，我們將建立一個圖表來顯示哪些性傳播感染被最頻繁地一起建模。
亞組分析
我們將使用質量評估的百分比量表來區分質量較高和較低的模型。我們將單獨比較這些子組，以檢查它們之間的差異。
我們將檢查通過灰色文獻搜索獲得的文章是否與通過已發表文獻數據庫搜索獲得的文章不同。
為了研究建模方法的使用趨勢和質量變化，我們將分別研究所有建模方法。
在低收入國家和高收入國家，或在低流行率和高流行率環境中，使用相同的方法對性傳播感染進行建模是可能的。盡管這些模型的輸入可能而且肯定會有所不同，但在這兩種情況下的技術方法可能是相同的。這就是為什麼我們不把搜索重點放在一個特定的背景上，而是稍後分別研究不同的收入子群體。
研究記錄和數據管理
來自不同搜索引擎和數據庫的結果將被下載。我們將把這些搜索結果導入一個新的空Endnote數據庫。為了保證結果的再現性，將保存該數據庫的備份。
尾注22將用於刪除副本。自動檢查重複的標題和出版年份。每個可能的副本將被手動刪除，以防止刪除非副本。重複消除後的備份將被保存。
所有獨特的文章都將導入到相同的Microsoft Access數據庫中。23在標題和摘要篩選和全文篩選後，將保存數據庫的備份。
將開發電子輸入表格，以收集從標題和摘要篩選、全文篩選和數據提取中檢索到的信息。這些表格將被所有參與文章篩選和數據提取的研究人員使用。這些表格將在微軟Excel和VBA編程中開發。在這些表格的幫助下提取的信息也存儲在Excel工作簿中，每個研究人員一個。這些工作簿將被導入Microsoft Access數據庫，用於進一步處理、質量評估、偏差評估和分析。
患者和公眾參與
本次評審不涉及患者或任何其他公眾成員。沒有患者或公眾參與研究問題和結果測量的製定、研究的設計和研究的實施。
倫理與傳播
本係統綜述未包括或使用患者水平的數據。
本綜述的目的是描述已發表的多sti模型的數量和質量。這樣做的一個局限性是我們將無法對研究結果進行薈萃分析。我們將總結所有結果，但我們將無法產生漏鬥圖等彙總數字，因為評審中包括的模型可能會報告一係列結果，但沒有單一可識別的結果進行評估。
我們將總結用於STI建模的方法，並評估現有多STI模型的質量。我們將不評估這些疾病模型的作者是否選擇了最合適的方法來回答感興趣的研究問題。
性傳播感染與非性傳播感染(例如艾滋病毒和結核病)相互作用的建模雖然在臨床上很重要，24不會在這篇綜述中進行審查，因為它不會回答我們的研究問題，並且超出了綜述的範圍。
我們將把研究結果發表在同行評議的期刊上，並在合適的會議上展示。本綜述的結果將用於多種性傳播感染疾病模型的開發，將英國環境中最重要的性傳播感染納入其中。
修正案
這是協議的第一個版本。到目前為止，這個版本沒有任何修改。如果必須對議定書進行修訂，則所有修訂都將列在關於審查結果的最終報告的表格中。
參考文獻
腳注
貢獻者FS是擔保人。FS根據JS、RH和GR的意見製定並完善了研究方案。FS將負責文獻檢索。FS和AH將進行數據提取。FS將與RH、JS和GR合作進行分析、解讀和報告撰寫。最終稿件由所有作者閱讀並通過。
資金這項研究由國家衛生研究所初級保健研究學院資助。
免責聲明這些觀點是作者的觀點，不一定是國家衛生研究院、英國國民健康保險製度或衛生部的觀點。
相互競爭的利益沒有宣布。
病人的同意不是必需的。
出處和同行評審不是委托;外部同行評審。