條文本
PDF
文摘
介紹基因組測序已迅速過渡到臨床實踐,改善患者的診斷和治療選擇遺傳疾病。然而,大規模基因組測序的實現麵臨著挑戰,尤其是附帶的回歸結果,指在測試過程中發現的遺傳變異的主要疾病無關的接受調查,但潛在的臨床意義。高質量證據評估健康狀況和成本收到附帶結果至關重要的采用基因組測序為臨床護理和理解采用基因組測序的意想不到的後果。我們的目標是評估的健康結果和成本收到附帶病人進行基因組測序的結果。
和分析方法我們將比較健康結果和接收成本,而不是接受,附帶成人癌症患者進行基因組測序的結果在一個混合方法的隨機對照試驗。二百六十名患者曾經曆了第一或二線癌症基因檢測和接收不提供信息的結果將招募從家族癌症診所在多倫多,安大略省。雙臂的參與者將得到癌症相關的結果。參與幹涉臂可以選擇接收的結果。我們的主要結果是心理壓力在2周後返回的結果。次要結果包括行為的後果,臨床和個人效用評估在12個月後返回結果和衛生服務利用和成本在12個月和5年。參與者的一個子集和提供者將完成對效用的附帶結果定性訪談。
道德和傳播本研究已通過臨床試驗安大略省流線型的研究倫理審查製度,為多個站點提供倫理審查和監督參與相同的臨床試驗在安大略省。
試驗結果將通過利益相關者共享車間,國家和國際會議,同行評議期刊。
試驗注冊號碼NCT03597165。
- 基因組測序
- 偶然的發現
- 二次結果
- 臨床實用程序
- 醫療服務利用和成本
- 隨機對照試驗
這是一個開放的分布式條依照創作共用署名非商業性(4.0 CC通過數控)許可證,允許別人分發,混音,適應,建立這個工作非商業化,和許可他們的衍生產品在不同的協議,提供了最初的工作是正確地引用,給出合適的信用,任何更改表示,非商業使用。看到的:http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/。
來自Altmetric.com的統計
本研究的優點和局限性
這個隨機對照試驗(RCT)將提供高質量的證據的結果和成本從基因組測序,獲得附帶結果(IR)提供關鍵證據的增加使用基因組測序和紅外光譜的識別。
大多數研究到目前為止隻有評估醫學上可操作的,承運人的回歸結果,然而這一個隨機對照試驗將為病人提供廣泛的紅外選項,代表了迄今為止最全麵的評估,我們知道。
我們的研究將包括定性采訪參與者和提供者,從而深入理解個人和紅外的臨床效用。
所有的參與者將可以選擇接收紅外研究結束的時期;然而,這限製了我們的能力比較接受的長期經濟成本和不接收紅外。
我們將招募親戚和提供者的參與者探討家庭溢出效應,與紅外保健後果和費用,代表一個獨特的機會來獲得新穎全麵洞察層疊IR對衛生服務的影響和家庭係統。
介紹
隨著測序技術的成本不斷降低,使用基因組測序(GS;包括外顯子組和基因組測序)是增加在臨床實踐中。1 2一個重要的倫理和政策挑戰是GS常常識別的結果(紅外;也稱為二次結果),它指的是基因變異的主要疾病無關的,但可能是也可能不是臨床上有用的。美國指南建議,個人經曆GS在臨床環境中提供相關的選項接受醫學上可操作的結果至少59基因。3其他指南建議返回結果從這些和其他基因。4個5歐洲和加拿大指南更為保守,建議GS針對基因組區域的主要指標測試,以減少IR。然而,紅外可能返回,病人接受紅外根據他們的偏好在預備考試谘詢確認。6 - 8在英國,調查人員被鼓勵回到臨床相關的紅外光譜,可操作的和與中度或嚴重的危及生命的疾病。9因此,普遍的共識是,接受臨床GS的患者應該選擇接收的紅外。3 4 7
盡管目前建議隻返回可操作的結果,病人和公眾似乎感興趣收到廣泛的紅外包括相關結果無法治愈的情況下,承運人狀態結果和一個較小的程度上意義不明的變體(VUS開頭)。10 - 13他們也表達興趣紅外賦予癌症的風險,神經係統和其他疾病。10 - 15這些首選項似乎一致假設的場景和真實生活環境10 12 13並在其他領域的醫學發現。例如,60% -90%的調查參與者表示傾向於接受從磁共振成像(MRI)偶然發現。16日17
學習各種類型的紅外激勵因素包括渴望學習個人健康信息和為未來做好準備。14一些評論員認為應該考慮病人的偏好決定返回的結果,不管它們是否滿足可控訴的情形閾值。13日18文獻表明,醫學上的定義可操作的結果是主觀的,在某些情況下,臨床醫生和患者感知結果,不是醫學上可操作的指導方針,有一些可控訴的情形和尋求醫療保健。3月19 - 21日鑒於醫療行動的不同解釋,一些人認為一個更全麵的方法可控訴的情形,除了臨床實用程序,個人效用也應該被認為是在塑造指南基因組的回歸結果。13日18
準備GS和主流的預期大規模實現基因組醫學臨床實踐,英國政府最近完成了100 000 100 000基因組測序基因組項目。22利用這些數據,研究人員將開發方法來簡化診斷過程,教育專業人士,和重要的是,建立框架返回IR。9日22
疾病風險減少紅外提供一個機會,很明顯,病人都熱衷於接受這些結果。然而,很少有研究評估實際健康狀況和經濟後果與接收基於病人選擇不同類別的紅外光譜。
研究的目的是
假設和目標
我們的目標是評估的後果接收紅外心理壓力,降低風險的行為,臨床和個人效用後的12個月的回歸結果,以及衛生服務在12個月內使用和成本,5年之後返回結果。我們假設,接受隻主要結果的病人相比,患者接受紅外將報告更高水平的短期心理壓力更降低風險的行為治療,屏幕或減少偶然發現疾病風險,和更高水平的臨床和個人效用,從而可能改善健康結果。此外,我們假設醫療服務利用率和成本將更高的病人接受紅外短期(1年)和長期(5年)。
和分析方法
研究背景
主要研究網站是聖邁克爾醫院(SMH)在多倫多,安大略省,加拿大,所有數據收集活動協調和數據存儲。參與者將從遺傳性癌症診所招募了西奈山醫院,新寧保健科學中心,瑪格麗特公主癌症中心位於多倫多。招聘2018年7月開始,預計將在2020年9月結束。
人口
我們選擇為我們的研究人群癌症患者,因為他們代表了很大一部分的病人可能接收紅外。癌症患者經常接受腫瘤DNA測序確認預後的生物標記和目標治療,25日- 27日通常伴隨著生殖係測序在正常組織的控製。生殖係GS也可能提供增加敏感性在經典的基因測試,導致改善診斷和減少耗時和昂貴的診斷級聯。28然而,生殖係測序也可能導致紅外的識別。因此,癌症患者代表可能收到GS IR的人口眾多。
包含和排除標準
我們設計了反映未來臨床資格的合格標準GS。
入選標準
個人和家庭的曆史癌症或息肉病遺傳性癌症綜合征的暗示。
之前不提供信息的基因測試結果(消極或執行(的vu))。
≥18歲。
說話和讀英語。
研究武器
病人的幹預和控製武器將GS癌症史。
幹預
參與幹涉臂將得到癌症的發現和選擇學習紅外從五個類別的結果(圖2)。12這些類別是伯格提出的基於麵元模型等。32類別是由可控訴的情形、疾病類型和繼承和被檢測表麵效度和理解。12我們設計了一個在線互動DA稱為“基因組學顧問”(www.genomicsadviser.com)12日31日裝箱框架和指導幹預相結合的參與者在選擇紅外(圖3)。基因組學顧問評估,發現是可以接受的,直觀的使用,並提供足夠的信息對於達成告知病人,value-congruent決定。12其有效性在減少決策衝突和提高知識為病人選擇紅外是另一個隨機對照試驗評估。31日
類別的附帶結果。12
GenomicsADvISER.com的概述。12
我們將為紅外報告致病性或可能致病變種(變體將疾病引起,按照美國大學醫學遺傳學和基因組學(ACMG)指南)。3 33對於癌症相關的結果,我們將執行報告的vu結果可能除了致病性和致病變種,鑒於VUS開頭可能會重新分類,並成為相關參與者的主要標誌。33 34
控製
參與者在控製臂隻會學習癌症相關GS結果(主要指標)和不接受紅外。占招聘偏見,參與者的控製杆將能夠獲得紅外研究的結論。
隨機
我們將連續隨機選擇和分配參與者從現有的合格科目列表使用電腦隨機在1:1的比例隨機排列的不同大小的塊,分層的診所。分配將生成的生物統計學家和藏在信封的團隊成員不參與管理的研究。參與者同意後並完成基線措施,研究協調員將打開信封,揭示了分配。
病人隨機幹預部門可能不希望他們的紅外光譜。這不大可能,因為至少> 90%選擇學習醫學上可操作的結果。35盡管如此,患者隨機幹預不會接收紅外;但他們將遵循和結果將被包含在意向處理(ITT)分析按標準個隨機對照試驗程序不服從。36
偏見的風險
後分配的研究部門,研究小組和參與者不會被分配,由於性質的幹預。每個參與者將盲目地將代碼和數據分析。代碼分析完成後將訪問。
假設、理論框架、結果和分析
目標1
評估接收紅外的心理後果
假設
與接受隻主要結果的病人相比,患者接受紅外在短期內將報告更高水平的痛苦(2周),基於基因檢測研究在這個人口。37
理論框架
Baum的壓力和基因檢測的模型假定遇險後基因檢測是影響疾病特征(如嚴重,可預防性),測試結果和不確定性減少的程度測試,38表明學習高風險紅外嚴重的或不可避免的疾病可能會導致增加痛苦。經驗證據支持這樣的預測。收到結果從單基因測試的一係列障礙似乎不利的心理影響,包括情緒困擾個人發現高危,但是這些影響是短暫的。39-43這種影響是否也適用於紅外從GS,包括多種疾病的結果,都是未知的。
結果
我們的主要結果,心理壓力,將在2周內評估,使用驗證醫院焦慮和抑鬱量表(了)。已經是最常用的衡量基因測試的全麵危機。37 44已經將在基線評估,結果後立即返回,和2周、6周、6個月和12個月後(表1)。
我們的二級心理結果由12項短形式的生活質量測量調查(SF-12),45情境壓力衡量事件的影響範圍修訂(IES-R)46-48和多維影響患癌症的風險評估和決策衝突的決策衝突規模,49管理按照時間表表1。基因歧視也將評估使用一個問卷50和GS知識將通過知識量表評估出來的,51按管理表1。
樣本大小
我們的主要終點是普遍的痛苦在2周使用了評估。這種方法有一個接受的最低限度2.5的重要區別。52我們希望增加壓力將來自偶然的發現,這隻會給實驗組。求救兩組之間的差異隻那些接受沒有結果或癌症相關的發現有望零。因此,任何差異將實驗組的因子集接收偶然發現。這組實驗組的預計將占70%。因此,減毒治療效果的1.75(2.5×0.7)曾預計將包括所有隨機患者。基於SD 130病人要求每個部門有80%的電力雙邊5%顯著性水平檢測治療效果有1.75的差異。52
分析
痛苦和二級結果的分析將遵循ITT的方法。我們的主要時間點已經是2周後返回的結果。意味著已經和所有基線措施的分數將在每個時間點相比使用協方差分析(ANCOVA)模型為基準調整值。提供的樣本大小是一個學習的差異。擬議的基線分析調整通過ANCOVA,比學習更大的權力,實質上對於中度到大基線之間的相關性和隨訪。
二次分析將為已知的預測調整的結果,如性別和疾病/ IR的性質。53我們將報告調整意味著差異和95%每個測量在每個後續的CIs。我們將執行一個線性混合效應模型作為輔助分析探索如果軌跡不同的組。我們還將報告參與者的比例分數> 11已經和> 23 IES-R,象征著痛苦的基線,後立即返回的結果和隨訪。
在每次隨訪時,我們將使用一個截止≥15個人的有屏幕上可能處於嚴重困境。54研究遺傳顧問將與這些參與者進行討論,參考他們心理健康專業或家庭醫生。beplay体育相关新闻
目標2
評估接收紅外的行為後果。
假設
與患者主要結果相比,患者接受紅外將報告更高水平的意圖和吸收的降低風險的行為基於醫學上的行動和行動的結果。
我們預計,大部分紅外發現通過GS不會醫學上可操作的。然而,我們認為這些結果仍可能觸發行為改變或臨床操作,將被收集來自多個數據源的數據,包括參與者的醫療圖表,自我報告的數據和臨床數據庫。
理論框架
擴展並行流程模型(EPPM)健康行為的變化表明,高風險的結果(在本例中紅外)可能激勵病人采取降低風險的行為,如果患者認為他們的風險高,自我效能感也很高。55遺傳自我效能是指一個人的信心在理解遺傳學對健康的作用,評估疾病和解釋個人遺傳風險基因問題需要其他個體。56
結果
我們將評估降低風險的行為和預防服務的意圖和吸收所有個隨機對照試驗參與者使用修改物品從美國疾病控製和預防中心的驗證行為風險因素監測係統(BRFSS)57NCI的健康信息國際趨勢調查(提示)。58從BRFSS和提示,我們已經調整了項目研究是否接收紅外影響參與者的意圖采取或其實際采用自我報告數的減少風險行為(如飲食或藥物變化)。符合EPPM模型,55我們還將評估風險認知和使用措施改編自文學遺傳自我效能。56 59
BRFSS、提示風險知覺和自我效能的措施將在基線管理,2周、6周、6個月和12個月後結果披露(表1)。參與者也將調查目的和實際溝通結果家庭成員和使用結果生殖決策為自己或孩子在每個時間點使用的問題源自於相關文獻。60
行為後果的親戚:在6周,6個月和12個月,參與者將調查了級聯測試,也就是說,基因檢測的主要引發的親戚或紅外識別參與者。這些數據將三角,在某種程度上,通過測量親戚;試驗參與者將被要求告知親屬和他們跟進很感興趣,給他們提供我們的聯係信息。如果親戚聯係我們並提供同意,我們將評估他們的預期和實際使用改編BRFSS項目降低風險的行為結果是6 - 12個月後回到試驗參與者。
分析
ITT的方法將緊隨其後。我們將報告的比例參與者和他們的親屬報告目的和采用的降低和生殖行為,是歸因於GS在每個時間點的結果。主要感興趣的時間點是6個月,將使用Χ相比2測試。絕對風險差異和95%可信區間將報道。如果數據允許,我們將探索人口或臨床變量是否使用多元邏輯回歸分析影響行為的改變。
目標3
評估紅外的臨床和個人效用。
定量階段
假設
臨床實用程序
醫學上可操作的結果:我們預計,1% -5%的參與者選出接受醫學上可操作的紅外將獲得這樣的結果。61年
當中可操作的結果:參與者選出獲得常見疾病單核苷酸多態性(snp),運營商地位或藥物基因組學的結果,我們預計,84% - -100%會收到這樣的紅外光譜。4 61 62
醫療行為:我們預計,醫學上可操作的紅外將觸發更多的臨床操作而當中可操作的紅外光譜。然而,鑒於當中可操作的紅外光譜的高患病率,我們預期,更多的人將報告臨床實用程序基於當中可操作的結果相比,醫學上可操作的紅外光譜。
感知效用
與患者主要結果相比,患者接受紅外將報告更高水平的感知效用。
結果
我們將評估紅外根據既定標準的臨床效用評估臨床基因檢測結果的效用。63 64
診斷產量:我們將文檔的總數IR,醫學上的數量和頻率,當中可操作的結果在五個類別的紅外光譜和紅外每個病人的平均數量。
臨床操作:一年之後,返回的結果,我們將記錄醫療行為的數量和類型推薦,完成後,返回通過病人的紅外圖審查。
感知效用:在我們的研究中,我們定義了效用視為臨床效用和個人效用,將評估使用盧波開發的規模等,65年每低於輔以定性階段。
分析
我們將報告的IR和臨床操作整個類別的IR和病人,95% CI在適當的時候。我們將探討協變量之間的關聯和感知效用。以前的文獻表明,社會人口變量不是感知效用的重要預測因子。65年因此,如果允許的數據,我們將探討是否臨床變量,容忍歧義和哈巴狗預測紅外使用序數回歸模型的感知效用。
定性的階段
我們將使用深度訪談與病人和他們的供應商提供進一步洞察紅外的方式可能有實用程序。
理論框架:紮根理論68年將被用作定性方法,因為它通常是用來探索基本社會過程基於符號互動論的理論假設。69年
定性訪談:我們將進行半結構化訪談探索臨床實用臨床醫生和臨床效用和個人效用的參與者的紅外結果是9 - 12個月後返回使用麵試指南開發基於文獻綜述和專家谘詢。紅外未必觸發臨床操作但仍有實用程序對病人及其家屬。紅外光譜的定性訪談將提供洞察結果可能不被量化措施。
樣本大小
病人:我們將麵試40參與幹預的手臂,一個典型的紮根理論研究樣本量通常足以達到主題飽和。68 70 71我們首先要有目的跨類型的紅外接收樣本(如可行的單核苷酸多態性,航母結果),然後從理論上示例基於新興的發現。72 73
供應商:病人的許可,我們將采訪專家(n = 15 - 20)的一個子集71年幹預患者被稱為參與者的家庭醫生的一個子集(n = 15 - 20)71年9 - 12個月後返回結果。這些將構成匹配樣本的病人和他們的醫生。15 - 20是一個典型的定性研究樣本量與專業人士和足夠達到飽和的主題。68 70 71我們將使用抽樣的最大變化72年確保數據反映出人口和跨多個地層廣泛的實踐,提供經驗和GS的結果。
定性分析
數據分析將利用紮根理論方法。68 74定性數據分析與數據收集並發初步探索的主題,並相應地修改麵試指南。74 - 78使用HyperRESEARCH,定性數據分析軟件,我們將對數據排序通過尋找主題和變化在和采訪。我們將首先開放的編碼數據,其中包括標簽和描述性數據代碼。兩個團隊成員將代碼獨立記錄和討論他們的分析,直到達成共識。兩分的協議和評估intercoder kappa係數計算的可靠性。下一步涉及常數相比,代碼將相比在訪談來確定共同的主題和它們之間的關係(軸向編碼)。72 - 74 77最後一個階段是選擇性編碼,代碼集成構建一個理論或解釋性模型。三角和成員檢查將被用作驗證方法。78 79
目標4
評估接收紅外的經濟後果。
假設
衛生服務利用率,因此醫療服務費用將在病人接受更高的患者相比,紅外接收主要結果。
數據源
我們將評估醫療服務利用和成本與接收紅外使用數據從研究和臨床評價科學研究所(IC / ES),安大略省居民房屋衛生行政數據的一個組織。每個參與者將與一個獨特的醫療保險管理數據庫在IC / ES。病人的記錄將從IC / ES分析12個月短期分析(與上次點的措施管理個隨機對照試驗)和5年之後返回的結果進行長期分析。
衛生服務利用
我們將分析衛生服務使用,比如醫生,急診、門診,住院,醫療過程(如手術、篩選),實驗室調查和額外的測試包括成像。我們將隻考慮服務產生的衛生係統。
衛生服務成本
我們將檢查的總成本,並使用,通過兩者之間的類型的服務12個月和5年後學習小組。結果是增量成本的幹預(小學和IR)與控製(主要結果)從公共衛生的角度係統付款人在研究期間。
衛生服務利用和經濟後果的親戚
對於參與的親戚,我們將評估衛生服務使用上麵描述的使用類似的方法和各自的成本占醫療和當中的溢出效應的紅外GS。的親戚,我們也致力於滿足這些數據與自我報告的數據。
分析
衛生服務利用
我們將描述的類型和頻率使用衛生服務病人接受紅外與不接收紅外。
二次分析,我們將探討的潛在經濟後果接收紅外醫療服務利用率使用兩部分模型(邏輯模型的利用率和負二項模型傾向的強度利用率)。45 46 80 81這些發現可以幫助解釋潛在的醫療服務使用差異這兩個學習小組。
衛生服務成本
我們將進行描述性分析報告醫療成本。隨後,我們將分析總成本作為因變量,利用回歸模型,估計預期的醫療成本的差異在兩臂之間。幹預變量將主要的獨立變量,回歸模型將調整為潛在的混雜變量(如年齡、性別和家庭曆史)在一個廣義線性模型。82 83我們將探討不同的鏈接功能和家庭分布(如日誌鏈接和γ的家人)促進仔細調查各種假設的影響對我們的結論。作為二次結果,我們將進行分析從社會的角度來看,我們從公共衛生係統包括所有成本付款人的角度來看,包括參與者和他們的親屬付現成本使用研究數據。研究結果的不確定性將探索和使用方法的特征,如95%可信區間。
另外,如果數據允許,我們將探索紅外的潛在成本效益。例如,我們將評估的成本效益接收紅外的增量成本為一個質量調整生命年。健康相關的生活質量數據(SF-12)將收集從一個隨機對照試驗和轉化為健康效用使用驗證算法。45 84成本將包括以上描述的。我們將探索一個成本效益分析超過一年,在5年時間內確定是否接收紅外是一個總成本或節省公共衛生係統。
招聘和招生
圖4概述了招聘過程。符合條件的患者將被告知研究遺傳顧問的招聘診所。感興趣的參與者將被安排在一個初始麵對麵會議在SMH研究協調員和研究遺傳顧問。
招聘過程。SC,研究協調員;GC、遺傳顧問
定性的招聘程序
參與者的一個子集接收紅外,他們的家庭醫生和專家將被邀請參加麵試。
研究流
圖1概述了研究過程。有興趣的參與者將同意在麵對麵的會議和隨後完成基線措施,其次是隨機。研究措施將使用研究收集和管理電子數據捕獲(搬運工)。85年搬運工數據庫將訪問批準研究小組的成員。服務器在SMH由應用健康管理研究中心。每個團隊成員都有自己的單獨的登錄名和密碼。所有數據都將繼續在SMH安全服務器。
隨機後,參與者在雙臂將收到從認證的基因遺傳谘詢顧問。參與幹涉臂將使用DA選擇紅外研究遺傳顧問提供的額外輔導。
會議同意後,將被試的外顯子組測序使用庫存樣本的DNA或從一個新鮮的血液樣本中提取如果傾斜DNA不可用。
中心的所有DNA樣本測序應用基因組學(TCAG)在多倫多。TCAG將提供原始測序數據要看更多有關憩苑的轉移到一個安全的網站/合成(西奈醫療係統);數據分析使用一套軟件工具,遵循最佳實踐分析,外顯子組數據由JLE啦。研究團隊將評估為致病性變異使用建立指導方針和歸類的結果。33分析完成後,由董事會報告將生成注冊臨床分子遺傳學家JLE(學位證書持有者的美國醫學遺傳學和基因組學、DABMG和其他美國大學的醫學遺傳學和基因組學,FACMG),導演和先進分子診斷實驗室負責人要看更多有關憩苑(AMDL)或JCC (FACMG)和分析團隊。
一旦生成報告,學習顧問將與RHK谘詢,臨床遺傳學家個隨機對照試驗,主要和IR對適當的操作。研究遺傳顧問將這個信息傳遞給招聘遺傳顧問和在一起,他們將返回的結果製定一個計劃。
結果會話後,研究遺傳顧問,谘詢JLE RHK,將開發谘詢筆記總結結果,建議,建議推薦為主要結果和紅外光譜。參考筆記將會轉發到招聘診所,這將促進推薦到合適的遺傳學診所臨床確認和谘詢。加快係統已經建立與當地遺傳學診所為參與者的積極成果促進任命審判。每個參與者和他們的家庭醫生會收到谘詢報告(在線補充文件2、3)。結果會話後,後續措施將被評估在電話裏SMH研究協調員/時間表表1。如果參與者錯過任何一個會話,我們將跟進他們,以確保他們按時完成他們的措施。對於這項研究的參與者退出,我們仍將獲得他們的醫療記錄和評估他們的健康狀況。
我們還將給每個參與者的家庭醫生去信通知他們的病人的報名(在線補充文件4)。
參與者可以在任何時候選擇離開書房。如果參與者把他們的DNA測序之前,他們的樣本將被摧毀。參與者離開測序後,原始的序列數據將被摧毀,除非它已經上傳到數據庫。在這種情況下,數據從數據庫不會移動,但參與者可以選擇把他們的數據從研究本身。任何分析的結果,包括測序數據和其他信息記錄在撤離之前,仍將是研究人員所使用的目的,但將不會收集任何新的信息。
任何供應商同意將答應了采訪研究協調員和通過電話采訪。
基因組測序和裝箱框架
GS將使用新一代測序2500年Illumina公司HiSeq執行平台。原始的序列讀取要看更多有關憩苑SMH將在安全的網站分析,使用AMDL GS管道使用替代和驗證軟件工具,旨在對內部標準。
對照組的參與者,原始測序數據過濾排除變異與癌症無關,所以實驗室和研究團隊蒙蔽常見的結果。因此,為紅外不會變異分析,直到這些參與者的1年時間點。在醫學上可操作的紅外是無意中發現控製分析過程的參與者,結果將立即返回到參與者,不會被扣留,直到研究結束的。
主要癌症跡象,151個基因的列表是使用基因遺傳性癌症生成麵板著名實驗室出具Invitae GeneDx,櫥櫃,遺傳學和體細胞突變在癌症v86數據庫的目錄。
幹預參與者將選擇紅外使用修改後的版本伯格提出的麵元結構,上麵所描述的32(圖2)。我們裝箱的發展結構和列表了。86年12短暫,本1包括醫學上可操作的基因和開發使用推薦的59基因ACMG和臨床基因組資源的可操作的基因。3 87目前,該列表包含90個基因。本1還包括藥物基因組變異,從藥物基因組學知識庫中提取,一個公開的互動的藥物基因組學數據庫變體。本2由snp常見疾病(如年齡相關性黃斑變性)。單核苷酸多態性的變化一個個體間在DNA序列的位置,可以與小型發展中疾病的增加或減少的風險。單核苷酸多態性,達到全基因組意義(p < 5×10−8),據報道或≥2.0 NHGRI-EBI目錄(V.1.0.2)的全基因組關聯研究包含出版。本3是由所有與孟德爾疾病相關的基因不包括在本1或本4;生成列表中使用在線孟德爾遺傳的人。88年本4由早發性神經障礙,如早發性家族性阿爾茨海默氏症。89 - 915本,載體的結果,臨床使用的開發利用基因測序探索性研究財團。92年
病人和公眾參與
病人我們最近成立了一個谘詢委員會,我們將進行我們的審判。這些病人參與行為的研究和報告。
道德和傳播
道德
如果協議需要修改,修訂將提交Streamlined研究倫理審查製度。所有更改將溝通研究小組和倫理委員會。如果有任何變化,直接影響患者或需要同意,所有登記患者將通知更改。所有參與者將同意親自研究協調員,誰會詳細審查形式,回答問題並獲得許可訪問病曆信息。參與者將收到一份表格(在線補充文件5)。所有收集的信息都將保密。會有數據和樣本SMH和每個站點之間傳輸協議。這項研究將沒有數據監測委員會考慮到我們並不預期嚴重的不利影響,沒有要求我們研究研究倫理委員會(猶太人的尊稱)。保證質量的行為研究,聖邁克爾醫院研究倫理委員會並定期進行審計的研究。
傳播
我們打算分享結果通過地方、國家以及國際會議和出版物的同行評議期刊。作者資格將基於國際醫學期刊編輯委員會。此外,我們將組織一個利益相關者車間與遺傳谘詢師,遺傳學家,腫瘤學家、家庭醫生、實驗室專業人員和患者發展建議優化從GS在臨床實踐中紅外的回歸。我們的團隊也將使用GEC-KO(遺傳學教育加拿大)(http://geneticseducation.ca),其中JCC監視點,為了發展教育材料在紅外總經理初級保健醫生,基於研究結果。最後,我們將開發政策簡報與我們的政策合作夥伴從醫療質量安大略省和加拿大藥物和技術在衛生機構通知衛生技術評估和GS的融資決策。
最後的實驗數據集將訪問的首席研究員,立即研究小組和生物統計學家。
確認
我們要感謝以下人支持這項研究:卡洛琳Piccinin, Laura Winter-Paquette卡拉Semotiuk,塔裏亞曼庫索,賈斯汀洛倫茲,凱倫·奧特雅艾爾Silberman,羅謝爾Demsky,亞曆山德拉Volenik Jeanna McCuaig。
引用
腳注
合作者偶然的基因組學研究小組:伊馮轟炸(π);蘇珊·蘭德爾Armel;Melyssa阿倫森;南希·巴克斯特;肯債券;Jose-Mario Capo-Chichi;6月c·卡羅爾;蒂莫西·考爾菲德;馬克·克勞森;Tammy j·克利福德; Iris Cohn; Irfan Dhalla; Craig C. Earle; Andrea Eisen; Christine Elser; Mike Evans; Emily Glogowski; Tracy Graham; Jada G. Hamilton; Wanrudee Isaranuwatchai; Monika Kastner; Raymond H. Kim; Andreas Laupacis; Jordan Lerner-Ellis; Chantal F. Morel; Michelle Mujoomdar; Kenneth Offit; Seema Panchal; Mark Robson; Stephen W. Scherer; Adena Scheer; Kasmintan A. Schrader; Terrence Sullivan and Kevin E. Thorpe.
貢獻者構思、設計和YB領導這項研究的協議。YB,刃,艾爾和合作協議。MC合作設計研究和寫的協議。偶然的基因組學研究小組的成員包括CFM,如ka, JGH, KO,先生,JCC, RHK, JL-E RK,呃,黨衛軍,生產,厘米,K-RZ和射頻協議的設計。MC,黨衛軍,厘米,RK,呃,CE、SP、AE, TG, MA和SRA將協助數據收集。黨衛軍,MC和CM協助起草手稿。所有作者閱讀和批準最終的手稿
資助聲明本研究支持基金會從加拿大衛生研究院的研究和生活質量的撥款從加拿大癌症協會研究所授予YB(格蘭特數字143310年和705665年,分別)。YB是支持一個新的從加拿大健康研究所的研究員獎在本研究的進行。JGH, KO和先生支持NCI P30 CA008748。
免責聲明投資者沒有參與研究設計、數據收集和分析,決定發布或準備手稿。
相互競爭的利益沒有宣布。
病人同意出版不是必需的。
倫理批準安大略省的臨床試驗研究倫理審查製度(SRERS)已經批準了在參與學習網站。
出處和同行評議不是委托;外部同行評議。