抗原和人類metapneumoviruses的遺傳變異性
從屬關係
- PMID:15200856
- PMCID:PMC3323073
- DOI:10.3201 / eid1004.030393
項剪貼板
抗原和人類metapneumoviruses的遺傳變異性
緊急情況感染說。
2004年4月。
免費的PMC的文章
文摘
人類metapneumovirus (HMPV)是一個亞科的成員在家庭副粘液——viridae Pneumovirinae。其他成員的亞科,呼吸道合胞病毒和禽流感的肺炎病毒可分為子組遺傳或抗原差異的基礎上,或兩者兼而有之。HMPV,存在不同的基因血統被描述的基礎上變化的一組有限的可用的序列。我們解決抗原基因血統病毒中和試驗之間的關係。此外,我們分析了遺傳的多樣性HMPV序列的係統發育分析獲得的一部分融合蛋白(n = 84)和完整的附件蛋白質開放閱讀框架(n = 35)。序列之間的多樣性的基礎上附件蛋白基因和病毒中和滴度的差異,定義兩個HMPV種血清型。每個血清型可分為兩個遺傳譜係,但這些並未反映主要抗原差異。
數據
係統發育樹構建基於(A)部分F基因(ORF位置780 - 1221,n = 84)或(B)完整的G編碼區(開始G ORF開始L ORF, n = 35)。樹是由最大似然分析使用100精神,3撫慰人心。規模代表核苷酸變化的百分比顯示每棵樹。引導價值共識的基礎上樹,和相關的數字顯示在樹中。四個原型病毒粗體所示,橢圓畫。從荷蘭NL、病毒;從芬蘭FN、病毒獲得;英國,從英國獲得病毒;香港,病毒從香港;BR、病毒來自巴西。
融合蛋白基因的氨基酸序列比較原型人類metapneumovirus每個sublineage的隔離。預測信號肽、融合領域和膜錨在粗體斜體顯示類型,乳溝網站盒裝,該地區84年測序樣品是在黑體下劃線類型。時間顯示相同的氨基酸殘基的位置相對於隔離問/ 1/00。
的氨基酸序列比較公認的附件(G)人類每個基因sublineage metapneumovirus菌株的蛋白。對於每個sublineage隻有代表性樣本描述,導致24序列。被選出的代表序列,因此,從每年的樣本獲得至少一個序列描述,和隻有少數氨基酸序列替換被省略了。潛在的N -有關glysosylation網站強調,時間顯示相同的氨基酸殘基的位置相對於第一個序列在每個子群。數據顯示主要G子的核苷酸位置。
類似的文章
-
高遺傳多樣性的人類metapneumovirus的附件(G)的蛋白質。中國Microbiol。2004年8月,42(8):3406 - 14所示。doi: 10.1128 / jcm.42.8.3406 - 3414.2004。 中國Microbiol》2004。 PMID:15297475 免費的PMC的文章。
-
兩大人類metapneumovirus遺傳血統是高度相關的抗原,並融合(F)蛋白質抗原關係是一個主要因素。J微生物學報。2004年7月,78 (13):6927 - 37。doi: 10.1128 / jvi.78.13.6927 - 6937.2004。 J微生物學報》2004。 PMID:15194769 免費的PMC的文章。
-
G糖蛋白基因的遺傳變異的人類metapneumovirus。中國Microbiol。2004年8月,42 (8):3532 - 7。doi: 10.1128 / jcm.42.8.3532 - 3537.2004。 中國Microbiol》2004。 PMID:15297494 免費的PMC的文章。
-
(人類metapneumovirus呼吸道疾病的常見原因)。Vopr Virusol。2007 May-Jun; 52 (3): 4 - 8。 Vopr Virusol》2007。 PMID:17601042 審查。 俄語。
-
活疫苗對人類metapneumovirus反向遺傳學設計的。專家加速疫苗。2006年10月;5 (5):695 - 706。doi: 10.1586 / 14760584.5.5.695。 專家加速疫苗。2006。 PMID:17181442 審查。
引用的
-
人類的出現和潛在的基因血統滅絕Metapneumovirus在2005和2021之間。mBio。2023年2月28日,14 (1):e0228022。doi: 10.1128 / mbio.02280-22。Epub 2022年12月12日。 mBio。2023年。 PMID:36507832 免費的PMC的文章。
-
的安全性和免疫原性mRNA-Based人類Metapneumovirus和副流感病毒3型病毒疫苗在健康成年人相結合。開放論壇感染說。2022年5月1日,9 (7):ofac206。doi: 10.1093 / ofid / ofac206。eCollection 2022年7月。 2022年開放論壇感染說。。 PMID:35794943 免費的PMC的文章。
-
全球擴展和人類Metapneumovirus A2的優勢基因型與局部G基因重複。病毒。2022年5月16日,14 (5):1058。doi: 10.3390 / v14051058。 2022年病毒。。 PMID:35632799 免費的PMC的文章。
-
分析的hMPV F-specific抗體從人類記憶B細胞分離。Nat Commun。2022年5月10日,13 (1):2546。doi: 10.1038 / s41467 - 022 - 30205 - x。 Nat Commun》2022。 PMID:35538099 免費的PMC的文章。
-
人畜共患的起源人類Metapneumovirus:旅行從鳥類到人類。病毒。2022年3月25日,14 (4):677。doi: 10.3390 / v14040677。 2022年病毒。。 PMID:35458407 免費的PMC的文章。 審查。
引用
-
- 柯林斯PL,麥金托什K, Chanock RM。1。呼吸道合胞體病毒。編輯:H.P.M. Knipe。病毒學領域。費城:Lippencott威廉姆斯和威爾金斯;2001年。p . 1443 - 85。