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2013年12月,20 (e2): e239-42。
doi: 10.1136 / amiajnl - 2013 - 001889。 Epub 2013年10月31日。

使用自然語言處理推導並存病的醫療記錄

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使用自然語言處理推導並存病的醫療記錄

Hojjat Salmasianet al。 J是通知協會 2013年12月
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文摘

提取疾病表型研究是至關重要的,因為信息混雜並存病的效果。我們開發了一個自動化的方法,準確地確定並存病從電子醫療記錄。使用修改後的版本的Charlson發病率指數(CCI),兩個醫生創造了一個參考標準並存病的手動審查100年入學的筆記。我們處理筆記使用MedLEE自然語言處理係統,和寫查詢提取並存病自動從其結構化輸出。評分者間信協議參考集非常高(97.7%)。的方法產生一個F1得分0.761和總結CCI分數不是不同的參考標準(p = 0.329, 80.4%)。相比之下,從索賠數據產生一個F1獲得並存病得分0.741,由於低敏感性(66.1%)。因為CCI曾被驗證的預測死亡率和重新接納,我們的方法可以自動預測的結果。

關鍵詞:合並症;混雜因素;自然語言處理。

數據

圖1
圖1
散點圖的Charlson發病率指數總分計算測試集(N = 70),使用自動化的方法與手工計算的圖表回顧。圈的大小是成比例的患者數量來說,各自的分數計算每個方法。

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